{"id":1288,"date":"2013-07-30T13:56:52","date_gmt":"2013-07-30T13:56:52","guid":{"rendered":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=1288"},"modified":"2015-12-15T13:03:10","modified_gmt":"2015-12-15T13:03:10","slug":"wood-forms","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=1288","title":{"rendered":"WOOD ForMS"},"content":{"rendered":"<p><strong><a href=\"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/wp-content\/uploads\/2013\/07\/Screenshot-2015-12-15-13.49.40.png\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignleft  wp-image-8808\" src=\"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/wp-content\/uploads\/2013\/07\/Screenshot-2015-12-15-13.49.40.png\" alt=\"Screenshot 2015-12-15 13.49.40\" width=\"438\" height=\"285\" \/><\/a><\/strong><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>Les m\u00e9canismes de formation du bois soumis \u00e0 des stress<\/strong><\/p>\n<p><em>Responsable scientifique<\/em>: Dany Afif (UMR 1137 \u00ab\u00a0\u00c9cologie et Ecophysiologie Foresti\u00e8res\u00a0\u00bb \u2013 EEF)<\/p>\n<p><em>Partenaires Labex:<\/em>\u00a0 Mireille Caban\u00e9, Pascale Maillard (UMR 1137 &#8211; EEF)<\/p>\n<p>___________________________________________________________________________<\/p>\n<p><strong>Contexte<\/strong> \u2014 Le bois est une ressource importante pour diff\u00e9rentes industries. La biosynth\u00e8se de la cellulose et de la lignine, compos\u00e9s majeurs du bois, est fortement contr\u00f4l\u00e9e lors du d\u00e9veloppement de l\u2019arbre. Elle peut \u00eatre notamment affect\u00e9e par les stress abiotiques que l\u2019arbre subit dans le contexte actuel de changement climatique global. Il est en effet admis que des teneurs \u00e9lev\u00e9es en CO<sub>2<\/sub> augmentent la production de la biomasse, tandis que l&rsquo;ozone la r\u00e9duit. Il est donc particuli\u00e8rement important d&rsquo;\u00e9valuer l&rsquo;impact de ces deux gaz sur les m\u00e9canismes de formation du bois.<\/p>\n<p><strong>Objectifs<\/strong> \u2014 Le projet vise \u00e0 comprendre les m\u00e9canismes cellulaires qui contr\u00f4lent la biosynth\u00e8se de la cellulose et de la lignine dans le bois de peuplier soumis \u00e0 des stress. La formation du bois d\u00e9pend de la r\u00e9gulation des g\u00e8nes impliqu\u00e9s dans la biosynth\u00e8se des polym\u00e8res cellulose et lignine et de la fourniture en carbone pour chacun de ces polym\u00e8res, la r\u00e9partition du carbone entre ces deux polym\u00e8res pouvant \u00eatre alt\u00e9r\u00e9e en condition de stress.<\/p>\n<p><strong>D\u00e9marche<\/strong> \u2014 L&rsquo;analyse portera sur (i) la r\u00e9gulation des facteurs de transcriptions NAC\/MYB impliqu\u00e9s dans la formation du bois et sur leurs g\u00e8nes cibles dans les voies de biosynth\u00e8se de la cellulose et de la lignine; (ii) le contr\u00f4le m\u00e9tabolique par l&rsquo;analyse du <sup>13<\/sup>C nouvellement incorpor\u00e9 par la cellulose et la lignine ainsi que l\u2019\u00e9tude de la r\u00e9partition de ce carbone entre les deux polym\u00e8res.<\/p>\n<p><strong>R\u00e9sultats marquants<\/strong> \u2014<\/p>\n<ul>\n<li>La biosynth\u00e8se de la cellulose dans le bois de peuplier soumis \u00e0 un stress ozone est fortement alt\u00e9r\u00e9e. L\u2019incorporation du <sup>13<\/sup>C dans la cellulose diminue, donc vraisemblablement la synth\u00e8se est diminu\u00e9e. L\u2019analyse mol\u00e9culaire a port\u00e9 sur 18 g\u00e8nes de cellulose synthase (CesA), des g\u00e8nes impliqu\u00e9s dans la fourniture de substrat pour CesA (UGP, SUSY) et des g\u00e8nes impliqu\u00e9s dans le d\u00e9p\u00f4t et la cristallinit\u00e9 de la cellulose (Korrigan et COBRA). L\u2019expression de g\u00e8nes de CesA impliqu\u00e9s dans la formation de paroi secondaire diminuent fortement. Les g\u00e8nes UGP et SUSY et certain g\u00e8nes de Korrigan et COBRA suivent le m\u00eame profil. En revanche, des g\u00e8nes de CesA impliqu\u00e9s dans la synth\u00e8se de cellulose de paroi primaire sont fortement stimul\u00e9s, il en est de m\u00eame pour certains g\u00e8nes Korrigan et COBRA. Ceci sugg\u00e8re un r\u00e9arrangement de l\u2019architecture de la paroi. La formation du bois est sous le contr\u00f4le de facteurs de transcription. Cinq g\u00e8nes ont \u00e9t\u00e9 analys\u00e9s (WND \/ MYB \/ KNAT7). Tous montrent un profil d\u2019expression identique \u00e0 celui observ\u00e9 pour les CesA de paroi secondaire. Ils sont donc r\u00e9gul\u00e9s en r\u00e9ponse \u00e0 des stress<strong><strong>.<\/strong><\/strong><\/li>\n<li>L\u2019incorporation du <sup>13<\/sup>C dans la cellulose en condition de fort CO<sub>2<\/sub> est augment\u00e9e, ceci sugg\u00e8re une stimulation de la synth\u00e8se. En revanche l\u2019expression des diff\u00e9rents g\u00e8nes, cit\u00e9s pr\u00e9c\u00e9demment, reste inchang\u00e9e ou diminue mod\u00e9r\u00e9ment.<\/li>\n<li>La combinaison des deux gaz a un effet interm\u00e9diaire, ainsi le CO<sub>2<\/sub> \u00e9lev\u00e9 semble att\u00e9nuer l\u2019effet de l\u2019ozone.<\/li>\n<li>La diminution de la teneur en cellulose est \u00e0 mettre en lien avec celle de la lignine. Le ratio cellulose \/ lignine diminue quel que soit le stress, malgr\u00e9 la diff\u00e9rence d\u2019incorporation du <sup>13<\/sup>C entre les stress ozone et CO<sub>2<\/sub> \u00e9lev\u00e9.<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>Principales conclusions<\/strong> \u2014 L\u2019ozone est le stress qui a le plus d\u2019effets sur la formation du bois. Les modifications de la biosynth\u00e8se des parois secondaires (tr\u00e8s importantes dans le bois) et primaires laissent sugg\u00e9rer un remodelage de la paroi cellulaire. Les facteurs de transcription qui contr\u00f4lent la formation du bois sont r\u00e9gul\u00e9s en r\u00e9ponse au stress ozone. La balance cellulose \/ lignine dans le cas de stress d\u00e9terminera des nouvelles propri\u00e9t\u00e9s du bois.<\/p>\n<p><strong>Perspectives<\/strong> \u2014 Ces r\u00e9sultats nous m\u00e8nent (i) \u00e0 \u00e9tablir des r\u00e9seaux de r\u00e9gulation mol\u00e9culaire en condition de stress en utilisant la strat\u00e9gie RNAseq; (ii) \u00e0 rechercher des g\u00e8nes controlant la balance cellulose \/ lignine (iii) \u00e0 \u00e9valuer l\u2019impact de l\u2019allocation du carbone vers les tiges sur le contr\u00f4le de la balance cellulose \/ lignine.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Les m\u00e9canismes de formation du bois soumis \u00e0 des stress Responsable scientifique: Dany Afif (UMR 1137 \u00ab\u00a0\u00c9cologie et Ecophysiologie Foresti\u00e8res\u00a0\u00bb \u2013 EEF) Partenaires Labex:\u00a0 Mireille Caban\u00e9, Pascale Maillard (UMR 1137 &#8211; EEF) ___________________________________________________________________________ Contexte &hellip; <a href=\"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=1288\">Continuer la lecture <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":4,"featured_media":0,"parent":2122,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-1288","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/1288","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/4"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=1288"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/1288\/revisions"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/2122"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=1288"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}