{"id":376,"date":"2013-03-25T08:15:03","date_gmt":"2013-03-25T08:15:03","guid":{"rendered":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=376"},"modified":"2015-06-16T10:54:29","modified_gmt":"2015-06-16T10:54:29","slug":"comicsoft","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=376","title":{"rendered":"CoMicSoft"},"content":{"rendered":"

Vers la compr\u00e9hension des dialogues microbiens dans les sols forestiers : \u00e9tude des \u00e9changes m\u00e9taboliques entre\u00a0Streptomyces\u00a0et\u00a0Pseudomonas<\/strong><\/span><\/p>\n

Responsable scientifique : <\/em>Bertrand Aigle (UMR 1128 Dynamique des g\u00e9nomes et adaptation microbienne)<\/span><\/p>\n

Partenaires LabEx<\/em> :\u00a0Pierre Leblond, Justine Galet (Dynamique des g\u00e9nomes et adaptation microbienne),\u00a0Pascale Frey-Klett, Aur\u00e9lie Deveau (Interactions Arbres-Microorganismes)<\/span><\/p>\n

Collaborations<\/em> :\u00a0Pieter C. Dorrestein, Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences,University of California, San Diego (UCSD)<\/span><\/p>\n

______________________________________________<\/p>\n

Contexte<\/em>\u2014<\/strong> Les communaut\u00e9s microbiennes jouent des r\u00f4les importants dans l’\u00e9cosyst\u00e8me sol forestier, notamment via leur participation au recyclage de la mati\u00e8re organique et \u00e0 la nutrition des arbres. Dans leur niche \u00e9cologique, les microorganismes ne se comportent pas comme des entit\u00e9s ind\u00e9pendantes. En effet, ils manipulent leur environnement et communiquent avec les populations microbiennes voisines dans un processus d\u00e9sign\u00e9 \u00ab\u00a0\u00e9changes m\u00e9taboliques\u00a0\u00bb. L’ensemble de ces \u00e9changes jouent un r\u00f4le cl\u00e9 dans la structuration des communaut\u00e9s microbiennes, leur r\u00e9silience face aux perturbations externes et le d\u00e9veloppement et la sant\u00e9 des plantes. Pourtant, tr\u00e8s peu de connaissances existent sur l’ensemble des acteurs mol\u00e9culaires impliqu\u00e9s dans ces \u00e9changes.<\/span><\/p>\n

Objectifs<\/em>\u2014<\/strong> Les objectifs de ce projet sont (i) d’\u00e9tudier les \u00e9changes m\u00e9taboliques entre deux souches bact\u00e9riennes mod\u00e8les, Pseudomonas fluorescens<\/em> BBc6R8 et Streptomyces ambofaciens<\/em> ATCC23877, (ii) d’identifier les mol\u00e9cules qui agissent comme signaux de communication et (iii) de caract\u00e9riser les acteurs mol\u00e9culaires impliqu\u00e9s dans la transduction de ces signaux ainsi que les voies m\u00e9taboliques r\u00e9pondant \u00e0 ces signaux.<\/span><\/p>\n

D\u00e9marche<\/em>\u2014<\/strong> Pour d\u00e9crypter les dialogues microbiens, les interactions seront analys\u00e9es par spectrom\u00e9trie de masse coupl\u00e9e \u00e0 de l’imagerie permettant de visualiser de fa\u00e7on spatio-temporelle le profil m\u00e9tabolique des colonies microbiennes en interaction. La s\u00e9quence g\u00e9nomique de chacun des partenaires \u00e9tant disponible, nous couplerons cette approche \u00e0 des analyses transcriptomiques de chaque partenaire pour acc\u00e9der aux voies de transduction des signaux ainsi qu’aux voies m\u00e9taboliques influenc\u00e9es par ces dialogues inter-esp\u00e8ces.<\/span><\/p>\n

\u00a0<\/em>R\u00e9sultats et impacts attendus<\/em>\u2014<\/strong> D\u00e9crypter les dialogues entre microorganismes permettra de mieux comprendre le fonctionnement des communaut\u00e9s microbiennes des sols et notamment d\u2019appr\u00e9hender l\u2019effet de ces communaut\u00e9s sur les microorganismes qui interagissent directement avec les arbres et modifient la croissance de ces derniers. Les connaissances acquises devraient \u00eatre particuli\u00e8rement utiles dans le futur pour la mise en place de bonnes pratiques en ing\u00e9nierie \u00e9cologique permettant d’optimiser le fonctionnement des sols forestiers.<\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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