{"id":390,"date":"2013-03-25T09:32:40","date_gmt":"2013-03-25T09:32:40","guid":{"rendered":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=390"},"modified":"2015-12-15T11:16:53","modified_gmt":"2015-12-15T11:16:53","slug":"symwood","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=390","title":{"rendered":"SYMWOOD"},"content":{"rendered":"

\"symwood<\/a><\/strong><\/p>\n

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G\u00e9nomique comparative et biochimie des m\u00e9canismes fongiques impliqu\u00e9s dans la symbiose mycorhizienne et les processus de d\u00e9composition du bois<\/strong><\/p>\n

Responsables scientifique : Francis Martin &\u00a0Eric Gelhaye<\/em> (UMR 1136 Interactions Arbres\/Micro-organismes)
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Partenaires Labex : Philippe G\u00e9rardin (Laboratoire d’Etudes et de Recherche sur le Mat\u00e9riau Bois\u00a0 LERMAB)<\/p>\n

Collaborations : Professeur David Hibbet (Clark University), Dr. Igor Grigoriev (Fungal Genomics Program, U.S. DOE Joint Genome Insitute, JGI)<\/p>\n

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Contexte<\/em> \u2014<\/strong> La lignocellulose est la principale source de biopolym\u00e8res des \u00e9cosyst\u00e8mes terrestres. Sa d\u00e9gradation (et donc le recyclage de ce puits de carbone) est particuli\u00e8rement \u00e9tudi\u00e9e du fait de ses nombreuses applications potentielles comme la production de biomol\u00e9cules, bio\u00e9thanol ou enzymes par exemple. Cette d\u00e9gradation est principalement r\u00e9alis\u00e9e par des champignons et notamment des agaromycetes saprophytes selon deux m\u00e9canismes distincts permettant de\u00a0 diff\u00e9rencier les champignons dits de pourriture brune de ceux dits de pourriture blanche. Les champignons ectomycorhiziens, qui jouent un r\u00f4le \u00e9cologique important en tant que symbiotes des arbres, appartiennent \u00e9galement aux agaricomycetes.<\/p>\n

Objectifs<\/em> \u2014<\/strong> Nous proposons d\u2019\u00e9tudier une cinquantaine de g\u00e9nomes d\u2019agaricomycetes, saprophytes et ectomycorhiziens, repr\u00e9sentatifs des \u00e9volutions ind\u00e9pendantes des traits de vie observ\u00e9es au sein de cette classe, dans le but d\u2019identifier les r\u00e9seaux de g\u00e8nes impliqu\u00e9s dans l\u2019adaptation de ces champignons \u00e0 leurs niches \u00e9cologiques. Nous \u00e9tudierons \u00e9galement l\u2019impact du polymorphisme g\u00e9nomique intra-esp\u00e8ce sur l\u2019adaptation \u00e0 son environnement de l\u2019agaricomycete lignivore\u00a0: Trametes versicolor<\/em><\/p>\n

D\u00e9marche<\/em> \u2014<\/strong> Par g\u00e9nomique comparative, nous avons caract\u00e9ris\u00e9 diff\u00e9rentes familles de g\u00e8nes impliqu\u00e9s dans la d\u00e9gradation de la lignocellulose chez les champignons lignivores et ectomycorhiziens (i.e., enzymes de d\u00e9gradation des polysaccharides de la paroi v\u00e9g\u00e9tale, oxidoreductases impliqu\u00e9es dans la d\u00e9polym\u00e9risation de la lignine). Afin de caract\u00e9riser \u00e9tudier le polymorphisme g\u00e9n\u00e9tique intrasp\u00e9cifique, nous avons compar\u00e9 les s\u00e9quences g\u00e9nomiques de 10 souches de Trametes versicolor<\/em> pr\u00e9lev\u00e9es sur diff\u00e9rents types de bois en d\u00e9composition.<\/p>\n

R\u00e9sultats marquants<\/em> \u2014<\/strong><\/p>\n