{"id":5651,"date":"2014-08-27T10:08:21","date_gmt":"2014-08-27T10:08:21","guid":{"rendered":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=5651"},"modified":"2015-12-15T16:22:10","modified_gmt":"2015-12-15T16:22:10","slug":"protcar","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=5651","title":{"rendered":"PROTCAR"},"content":{"rendered":"<p><a href=\"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/wp-content\/uploads\/2014\/08\/Screenshot-2015-12-15-17.16.41.png\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignleft size-full wp-image-8824\" src=\"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/wp-content\/uploads\/2014\/08\/Screenshot-2015-12-15-17.16.41.png\" alt=\"Screenshot 2015-12-15 17.16.41\" width=\"921\" height=\"242\" \/><\/a><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><strong>D\u00e9veloppement de modules prot\u00e9iques (PROTeic CARriers) pour la modification de fibres v\u00e9g\u00e9tales<\/strong><\/p>\n<p><em>Responsable scientifique : <\/em> Eric Gelhaye (UMR 1136 \u00ab\u00a0Interactions Arbres\/Micro-organismes\u00a0\u00bb &#8211; IAM)<\/p>\n<p><em>Partenaires LabEx<\/em> : Philippe G\u00e9rardin (LERMAB)<\/p>\n<p><em>Collaboration<\/em> : C. Segovia (CETELOR), N. Attenot (BIOLIE)<\/p>\n<p>_________________________________________________________<\/p>\n<p><strong>Contexte<\/strong> \u2014 La connaissance fine de l\u2019organisation structurale et chimique de la paroi v\u00e9g\u00e9tale, outre un enjeu de recherche fondamentale, constitue un point cl\u00e9 pour le d\u00e9veloppement de diff\u00e9rentes biotechnologies li\u00e9es \u00e0 la chimie du v\u00e9g\u00e9tal\u00a0: bioraffinerie, industrie textile, biotechnologie blanche, biocomposites, extraction de mol\u00e9cules d\u2019int\u00e9r\u00eat,\u2026 Cette variabilit\u00e9 est \u00e0 corr\u00e9ler avec celle des syst\u00e8mes enzymatiques mis en jeu par les micro-organismes pour d\u00e9grader puis min\u00e9raliser les diff\u00e9rents constituants de la paroi v\u00e9g\u00e9tale. Les micro-organismes (champignons et bact\u00e9ries) s\u00e9cr\u00e8tent en effet une multitude d\u2019enzymes permettant le fractionnement de la paroi et pr\u00e9sentant souvent une sp\u00e9cificit\u00e9 vis \u00e0 vis des diff\u00e9rents constituants. De nombreuses enzymes impliqu\u00e9es dans la d\u00e9gradation des carbohydrates (cellulose, h\u00e9micelluloses, pectines,\u2026) sont modulaires et pr\u00e9sentent un module de fixation \u00e0 leur substrat (Carbohydrate binding module) et un module catalytique responsable de la d\u00e9gradation. Elles sont appel\u00e9es des CAZYmes. En ce qui concerne les autres constituants de la paroi v\u00e9g\u00e9tale (lignines, extractibles, cires,\u2026), certaines Glutathion Transf\u00e9rases peuvent r\u00e9agir avec certains de ces compos\u00e9s. L\u2019id\u00e9e globale de PROTCAR \u00e9tait donc d\u2019utiliser ces enzymes (ou des modules les constituant) comme outils de caract\u00e9risation de la paroi v\u00e9g\u00e9tale<\/p>\n<p><strong>Objectifs et D\u00e9marche<\/strong> \u2014 L\u2019objectif principal de ce projet consistait \u00e0 valider la d\u00e9marche propos\u00e9e en produisant diff\u00e9rents modules prot\u00e9iques coupl\u00e9s \u00e0 un module fluorescent. Diff\u00e9rentes enzymes\/modules ont choisis en fonction de leur activit\u00e9\/affinit\u00e9 envers diff\u00e9rents constituants de la paroi v\u00e9g\u00e9tale. Ces modules ont \u00e9t\u00e9 test\u00e9s afin de valider l\u2019hypoth\u00e8se de d\u00e9part en utilisant des techniques de microscopie et de spectroscopie \u00e0 fluorescence.<\/p>\n<p><strong>R\u00e9sultats marquants<\/strong> \u2014<\/p>\n<ul>\n<li>Les prot\u00e9ines d\u2019origine bact\u00e9rienne LigE, LigF, CBM3a et la prot\u00e9ine fongique PcGSTFuA ont \u00e9t\u00e9 produites et purifi\u00e9es avec ou sans fusion mcherry.<\/li>\n<li>En collaboration avec la plateau xyloscience et en utilisant les outils de microscopie de la plateforme \u00e9cog\u00e9nomique, une m\u00e9thode permettant de visualiser et de quantifier l\u2019adh\u00e9sion des prot\u00e9ines test\u00e9es \u00e0 des coupes de ch\u00eane a \u00e9t\u00e9 d\u00e9velopp\u00e9e<\/li>\n<li>Sur coupes de ch\u00eane, apr\u00e8s num\u00e9risation des observations par microscopie confocale, on mesure quantitativement et significativement une adh\u00e9sion diff\u00e9rente des diff\u00e9rentes prot\u00e9ines test\u00e9es. Ces r\u00e9sultats sont en accord avec la composition du bois<\/li>\n<li>En utilisant ces modules prot\u00e9iques, une modification chimique de fibres de lin, de chanvre et de bambou a pu \u00eatre mise en \u00e9vidence (am\u00e9lioration de l\u2019hydrophobicit\u00e9)<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>Conclusion et Perspectives<\/strong> \u2014<\/p>\n<p>Ce programme visait \u00e0 mettre au point des outils enzymatiques permettant \u00e0 la fois la caract\u00e9risation et la modification de parois lignocellulosiques et plus particuli\u00e8rement. Ces outils sont actuellement utilis\u00e9s au sein de diff\u00e9rents programmes de recherche. Cette m\u00e9thodologie sera notamment utilis\u00e9e dans le cadre du programme NEWFIBRE d\u00e9velopp\u00e9 avec les partenaires ayant collabor\u00e9 sur ce programme\u00a0: la soci\u00e9t\u00e9 BIOLIE, le CETELOR et le LERMAB. Le programme NEWFIBRE financ\u00e9 par le FEDER et la R\u00e9gion Lorraine vise \u00e0 d\u00e9velopper une nouvelle fili\u00e8re \u00ab\u00a0fibre\u00a0\u00bb r\u00e9gionale et regroupe une grande partie des industries textiles pr\u00e9sentes en Lorraine. Une valorisation de ces travaux sous forme d\u2019un brevet est \u00e0 l\u2019\u00e9tude.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>&nbsp; D\u00e9veloppement de modules prot\u00e9iques (PROTeic CARriers) pour la modification de fibres v\u00e9g\u00e9tales Responsable scientifique : Eric Gelhaye (UMR 1136 \u00ab\u00a0Interactions Arbres\/Micro-organismes\u00a0\u00bb &#8211; IAM) Partenaires LabEx : Philippe G\u00e9rardin (LERMAB) Collaboration : C. Segovia (CETELOR), N. 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