{"id":5684,"date":"2014-09-04T09:50:01","date_gmt":"2014-09-04T09:50:01","guid":{"rendered":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=5684"},"modified":"2015-06-16T11:20:13","modified_gmt":"2015-06-16T11:20:13","slug":"impact-de-la-fertilite-sur-les-communautes-bacteriennes-alterantes","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=5684","title":{"rendered":"Impact de la fertilit\u00e9 sur les communaut\u00e9s bact\u00e9riennes alt\u00e9rantes"},"content":{"rendered":"<p><strong>Doctorant : <\/strong>Oc\u00e9ane Nicolitch<strong><br \/>\nUniversit\u00e9 <\/strong>: Universit\u00e9 de Lorraine, France<strong><br \/>\n<strong>Dur\u00e9e du contrat <\/strong><\/strong>: 2014-2017<\/p>\n<p><strong>Titre de la th\u00e8se<\/strong>\u00a0<strong>\u2014<\/strong> Impact of nutrient availability on the structure and functioning of the forest soil bacterial communities capable of weathering minerals<\/p>\n<p><strong>Equipe d\u2019accueil et encadrant(s) \u00a0\u2014<\/strong><strong><br \/>\nResearch teams<\/strong>\u00a0: <strong>\u00a0<\/strong>Ecogenomic Team, UMR 1136 Joint Research Unit for Tree\/Microorganism Interactions (IAM) and UR 1138 Research Unit for Forest Ecosystem Biogeochemistry (BEF)<br \/>\n<strong>PhD supervisors<\/strong>\u00a0: St\u00e9phane Uroz and Marie-Pierre Turpault<\/p>\n<p><em><strong>_______________________<\/strong><\/em><\/p>\n<p><strong>Contexte <\/strong><strong>\u2014<br \/>\n<\/strong>La disponibilit\u00e9 des nutriments est une param\u00e8tre fondamental des cycles biog\u00e9ochimiques qui r\u00e9git la fertilit\u00e9 d&rsquo;un sol et le fonctionnement d&rsquo;un \u00e9cosyst\u00e8me. Parmi les \u00e9cosyst\u00e8mes terrestres, les for\u00eats d\u00e9velopp\u00e9es sur sols pauvres en \u00e9l\u00e9ments nutritifs (historiquement les sols riches sont d\u00e9di\u00e9es aux cultures agricoles) de nos r\u00e9gions temp\u00e9r\u00e9es sont parmi les \u00e9cosyst\u00e8mes les moins amend\u00e9s par l&rsquo;Homme, en comparaison des sols agricoles, et qui de plus subissent une exploitation grandissante de la ressource bois. Cette exploitation foresti\u00e8re a pour cons\u00e9quence d&rsquo;accentuer l&rsquo;appauvrissement des sols, les \u00e9l\u00e9ments nutritifs accumul\u00e9s dans la biomasse des arbres n&rsquo;\u00e9tant plus recycl\u00e9s. Ces caract\u00e9ristiques n&#8217;emp\u00eachent pourtant pas les for\u00eats de croitre. Dans ce contexte, on peut se demander d&rsquo;ou proviennent les \u00e9l\u00e9ments nutritifs n\u00e9cessaires ?<\/p>\n<p>En dehors des apports li\u00e9s aux d\u00e9p\u00f4ts atmosph\u00e9riques et au recyclage des \u00e9l\u00e9ments nutritifs contenus dans les racines mortes et les feuilles, les min\u00e9raux du sol sont la source majeure de cations nutritifs disponible pour le fonctionnement de l&rsquo;\u00e9cosyst\u00e8me. La lib\u00e9ration des nutriments \u00e0 partir de ces min\u00e9raux (processus d&rsquo;alt\u00e9ration) devient d\u00e8s lors un processus d\u00e9terminant pour le bon fonctionnement de l&rsquo;\u00e9cosyst\u00e8me. Mais comment cette alt\u00e9ration min\u00e9rale s&rsquo;op\u00e8re-t-elle ? Quelles sont les contributions relatives des r\u00e9actions abiotiques et biotiques dans ce processus d&rsquo;alt\u00e9ration ?<\/p>\n<p>L&rsquo;enjeu actuel est de d\u00e9terminer : i) les acteurs et leurs interactions, ii) leur contribution au processus d&rsquo;alt\u00e9ration min\u00e9rale et \u00e0 la fertilit\u00e9 des sols, iii) d&rsquo;identifier les m\u00e9canismes mol\u00e9culaires impliqu\u00e9s dans le processus d&rsquo;alt\u00e9ration des min\u00e9raux et iv) les moteurs de la structuration des ces communaut\u00e9s microbiennes.<\/p>\n<p><strong>Objectifs et questions de recherche <strong><strong>\u2014<\/strong><\/strong><\/strong><br \/>\nLes objectifs de ce projet sont de tester l&rsquo;impact de la disponibilit\u00e9 en nutriments inorganiques (Ca, K, Mg et P) sur la structuration et le fonctionnement des communaut\u00e9s bact\u00e9riennes des sols forestiers capables d&rsquo;alt\u00e9rer les min\u00e9raux.<\/p>\n<p><strong>Enjeux scientifiques et socio-\u00e9conomiques <\/strong><strong><strong><strong>\u2014<\/strong><\/strong><\/strong><br \/>\nLes enjeux scientifiques visent \u00e0 mettre en \u00e9vidence les relations possibles entre fertilit\u00e9 des sols, structuration des communaut\u00e9s bact\u00e9riennes et promotion de la croissance des arbres. A terme, ces travaux devraient permettre d&rsquo;identifier des bioindicateurs de l&rsquo;\u00e9tat\/qualit\u00e9 des sols.<\/p>\n<p><strong>Approches m\u00e9thodogiques et r\u00e9sultats attendus <strong><strong><strong>\u2014<\/strong><\/strong><\/strong><\/strong><br \/>\nUne combinaison de m\u00e9thodes de microbiologie (pasteurienne et m\u00e9tag\u00e9nomique) et de sciences du sol, associant des approches terrain sur le site forestier de Montiers-sur-Saulx et en microcosmes sera utilis\u00e9e. Ces travaux devraient permettre d\u00e9valuer si les arbres s\u00e9lectionnent des communaut\u00e9s bact\u00e9riennes capables d&rsquo;am\u00e9liorer leur nutrition quelque soient les conditions de disponibilit\u00e9 en \u00e9l\u00e9ments nutritifs du sol.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Doctorant : Oc\u00e9ane Nicolitch Universit\u00e9 : Universit\u00e9 de Lorraine, France Dur\u00e9e du contrat : 2014-2017 Titre de la th\u00e8se\u00a0\u2014 Impact of nutrient availability on the structure and functioning of the forest soil bacterial communities capable of weathering minerals Equipe d\u2019accueil &hellip; <a href=\"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=5684\">Continuer la lecture <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":4,"featured_media":0,"parent":2122,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-5684","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/5684","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/4"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=5684"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/5684\/revisions"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/2122"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=5684"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}