{"id":7281,"date":"2015-05-12T14:09:20","date_gmt":"2015-05-12T14:09:20","guid":{"rendered":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=7281"},"modified":"2015-06-16T11:18:31","modified_gmt":"2015-06-16T11:18:31","slug":"caracterization-functionnelle-de-petites-proteines-secretees-chez-les-champignons-lignolytiques","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=7281","title":{"rendered":"Caract\u00e9rization functionnelle de petites prot\u00e9ines s\u00e9cr\u00e9t\u00e9es chez les champignons lignolytiques."},"content":{"rendered":"<p><strong>Doctorant\u00a0:\u00a0 <\/strong>Nicolas Valette<br \/>\n<strong>Universit\u00e9 \/ Institution\u00a0:\u00a0 <\/strong>Universit\u00e9 de Lorraine<br \/>\n<strong>Dur\u00e9e du contrat \u2014\u00a0<\/strong>Trois ans\u00a0 (2015-2018)<\/p>\n<p><strong>Titre de la th\u00e8se\u00a0\u2014\u00a0<\/strong>Caract\u00e9rization functionnelle de petites prot\u00e9ines s\u00e9cr\u00e9t\u00e9es chez les champignons lignolytiques.<span style=\"color: #3366ff;\"><br \/>\n<\/span><\/p>\n<p><strong>\u00c9quipe d\u2019accueil et encadrant(s)\u2014\u00a0<\/strong><br \/>\n\u00c9quipe\u00a0:\u00a0 UMR 1136 Interactions Arbres\/Micro-organismes (IAM)<\/p>\n<p><strong>Directeur de th\u00e8se<\/strong>:\u00a0 Eric Gelhaye<br \/>\n<strong>Co-directrice de th\u00e8se:\u00a0 <\/strong>M\u00e9lanie Morel-Rouhier<\/p>\n<p>______________________<\/p>\n<p><strong>Contexte \u2014\u00a0\u00a0<\/strong>La d\u00e9gradation du bois par les champignons lignolytiques est au c\u0153ur des recherches actuelles portant sur l&rsquo;am\u00e9lioration des processus de valorisation de la biomase v\u00e9g\u00e9tale. La plupart des \u00e9tudes concernent les syst\u00e8mes extracellulaires de d\u00e9gradation. En revanche, tr\u00e8s peu de donn\u00e9es sont disponibles concernant les processus associ\u00e9s qui permettent aux champignons de r\u00e9sister \u00e0 l\u2019environnement oxydant li\u00e9 \u00e0 la d\u00e9gradation du bois et en particulier aux extractibles qui peuvent \u00eatre toxiques pour la cellule. En plus des syst\u00e8mes classiques de r\u00e9ponse aux stress, des petites prot\u00e9ines s\u00e9cr\u00e9t\u00e9es (SSP) semblent jouer un r\u00f4le dans la r\u00e9ponse cellulaire \u00e0 ces extractibles. Leur fonction est actuellement inconnue mais une sp\u00e9cificit\u00e9 a pu \u00eatre entre l&rsquo;essence de bois et l&rsquo;excr\u00e9tion de ces enzymes.<\/p>\n<p><strong>Objectifs et questions de recherche\u00a0\u2014\u00a0 <\/strong>Le principal objectif du projet est de pr\u00e9ciser le r\u00f4le des SSP dans la physiologie du champignon (modification du bois, signal, r\u00e9ponse au stress, d\u00e9toxication..) lors de la d\u00e9composition du bois.<\/p>\n<p><strong>Enjeux scientifiques et socio-\u00e9conomiques\u00a0<\/strong>\u00a0<strong>\u2014\u00a0\u00a0<\/strong>Ce projet apportera de nouvelles donn\u00e9es sur la fonction de ces prot\u00e9ines nouvellement identifi\u00e9es dans la d\u00e9gradation du bois. Il ouvrira \u00e9galement de nouvelles perspectives dans l&rsquo;optimisation de la d\u00e9gradation de la biomasse par les champignons et dans les strat\u00e9gies de pr\u00e9servation du mat\u00e9riau bois (en utilisant les SSP comme cibles).<\/p>\n<p><strong>Approches m\u00e9thodologiques et r\u00e9sultats attendus<\/strong> <strong>\u2014 <\/strong>La caract\u00e9risation biochimique des SSP recombinantes permettra entre autres d&rsquo;identifier des ligands potentiels (mol\u00e9cules du bois et prot\u00e9ines). La r\u00e9solution de la structure 3D des complexes apportera des informations fonctionnelles compl\u00e9mentaires. De plus, une approche plus physiologique permettra de visualiser les interactions SSP\/bois gr\u00e2ce \u00e0 l&rsquo;utilisation d&rsquo;outils fluorescents. Nous avons \u00e9galement d\u00e9velopp\u00e9 la transformation g\u00e9n\u00e9tique de <em>Phanerochaete chrysosporium<\/em>, afin d&rsquo;\u00e9valuer l&rsquo;effet de la sur-expression ou de l&rsquo;inhibition des SSP <em>in vivo<\/em> par des approches ph\u00e9notypique et prot\u00e9omiques.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Doctorant\u00a0:\u00a0 Nicolas Valette Universit\u00e9 \/ Institution\u00a0:\u00a0 Universit\u00e9 de Lorraine Dur\u00e9e du contrat \u2014\u00a0Trois ans\u00a0 (2015-2018) Titre de la th\u00e8se\u00a0\u2014\u00a0Caract\u00e9rization functionnelle de petites prot\u00e9ines s\u00e9cr\u00e9t\u00e9es chez les champignons lignolytiques. \u00c9quipe d\u2019accueil et encadrant(s)\u2014\u00a0 \u00c9quipe\u00a0:\u00a0 UMR 1136 Interactions Arbres\/Micro-organismes (IAM) Directeur de &hellip; <a href=\"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=7281\">Continuer la lecture <span class=\"meta-nav\">&rarr;<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":4,"featured_media":0,"parent":2122,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-7281","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/7281","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/4"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=7281"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/7281\/revisions"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/2122"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=7281"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}