{"id":8914,"date":"2016-01-25T12:51:51","date_gmt":"2016-01-25T12:51:51","guid":{"rendered":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=8914"},"modified":"2016-01-25T16:09:06","modified_gmt":"2016-01-25T16:09:06","slug":"isabex","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/ARBRE\/?page_id=8914","title":{"rendered":"ISABEX"},"content":{"rendered":"

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Interactions between Saprotrophic Bacteria and the white-rot Phanerochaete chrysosporium<\/em> in presence of wood Extractives<\/strong><\/p>\n

Responsable scientifique : Sophie Mieszkin (UMR 1136 – Interactions Arbres\/Micro-organismes – IAM<\/p>\n

Partenaires Labex : Eric Gelhaye (IAM), Philippe G\u00e9rardin (LERMAB)<\/p>\n

Collaborations:\u00a0 St\u00e9phane Dumar\u00e7ay (LERMAB), Rodnay Sormani (IAM)<\/p>\n

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Contexte <\/strong>\u2014 A l\u2019\u00e9chelle des \u00e9cosyst\u00e8mes forestiers, la d\u00e9gradation du bois permet un recyclage important des nutriments et repr\u00e9sente une source de mati\u00e8re organique fra\u00eeche pour les microorganismes ligno-cellulolytiques. Cependant, lors de sa d\u00e9gradation, des compos\u00e9s de faible poids mol\u00e9culaire, appel\u00e9s extractibles, sont rel\u00e2ch\u00e9s. Ces compos\u00e9s, potentiellement toxiques, peuvent repr\u00e9senter une barri\u00e8re pour les microorganismes. Si le r\u00f4le des communaut\u00e9s fongiques concernant le recyclage du carbone et des nutriments est aujourd\u2019hui bien \u00e9tabli, le r\u00f4le des communaut\u00e9s bact\u00e9riennes, mais \u00e9galement les possibles interactions avec les champignons ont largement \u00e9t\u00e9 sous-estim\u00e9s. Des \u00e9tudes r\u00e9centes ont montr\u00e9 la complexit\u00e9 de ces interactions (compl\u00e9mentarit\u00e9 fonctionnelle ou non pour l\u2019une ou l\u2019autre, voir pour les deux communaut\u00e9s). Parmi ces \u00e9tudes, celle men\u00e9e au laboratoire IAM a permis de mettre en \u00e9vidence que l\u2019association du champignon de pourriture blanche Phanerochaete chrysosporium <\/em>RP78 et d\u2019une communaut\u00e9 bact\u00e9rienne isol\u00e9e de sa mycosph\u00e8re favorisait la cin\u00e9tique de d\u00e9gradation du bois. Le potentiel fonctionnel de l\u2019ensemble des bact\u00e9ries composant la communaut\u00e9 a \u00e9t\u00e9 caract\u00e9ris\u00e9, cependant, leur comportement vis-\u00e0-vis des extractibles du bois reste \u00e0 d\u00e9finir.<\/p>\n

Objectifs <\/strong>\u2014 Evaluer la r\u00e9ponse physiologique et le potentiel fonctionnel des microorganismes ainsi que le r\u00f4le des interactions champignons\/bact\u00e9ries en pr\u00e9sence d\u2019extractibles du bois.<\/p>\n

D\u00e9marche<\/strong>\u2014 Apr\u00e8s caract\u00e9risation des extractibles du h\u00eatre, du ch\u00eane et de l\u2019\u00e9pic\u00e9a, des cin\u00e9tiques de croissance bact\u00e9rienne et fongique seront r\u00e9alis\u00e9es en pr\u00e9sence d\u2019extractibles. Des co-cultures seront r\u00e9alis\u00e9es en pr\u00e9sence d\u2019extractibles pour suivre par culture\/num\u00e9ration ou qPCR l\u2019\u00e9volution des communaut\u00e9s afin de d\u00e9finir si les interactions sont du type compl\u00e9mentarit\u00e9 fonctionnelle ou comp\u00e9tition.<\/p>\n

R\u00e9sultats et impacts attendus<\/strong>\u2014 L\u2019impact des extractibles du bois, en fonction de leur origine, sur la croissance bact\u00e9rienne et fongique sera mieux caract\u00e9ris\u00e9. Le r\u00f4le des interactions bact\u00e9ries\/champignons sur la physiologie et le potentiel fonctionnel de ces microorganismes en pr\u00e9sence d\u2019extractibles sera mis en avant. Globalement, cette \u00e9tude permettra d\u2019apporter des \u00e9l\u00e9ments de r\u00e9ponse concernant le r\u00f4le des bact\u00e9ries dans la d\u00e9gradation du bois et plus particuli\u00e8rement au cours des interactions avec les champignons.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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