![\"IMG_0175_2\"](\"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/IAM\/wp-content\/uploads\/2014\/02\/IMG_0175_2.jpg\")
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The defense was held the 24th February 2014<\/strong>\u00a0at 13h30\u00a0in\u00a0Amphitheater 7,<\/strong>\u00a0Facult\u00e9 des Sciences<\/strong>, Boulevard des Aiguillettes, Vandoeuvre.<\/p>\n Today, St\u00e9phane Uroz successfully defended his HDR, entitled “Ecologie des interactions biotiques et abiotiques des communaut\u00e9s bact\u00e9riennes des sols: caract\u00e9risation des acteurs, des fonctions et des d\u00e9terminants g\u00e9n\u00e9tiques”. Congratulations St\u00e9phane for this brilliant defense! The defense was held the … Continue reading Composition du jury :<\/b><\/h1>\n
M. Christophe MOUGEL Directeur de Recherche INRA Rapporteur<\/h4>\n
M. Pascal SIMONET Directeur de Recherche CNRS Rapporteur<\/h4>\n
M. St\u00e9phane VUILLEMIER Professeur de l\u2019Universit\u00e9 de Strasbourg Rapporteur<\/h4>\n
M. Eric GELHAYE Professeur de l\u2019Universit\u00e9 de Lorraine Examinateur<\/h4>\n
M. Pierre LEBLOND Professeur de l\u2019Universit\u00e9 de Lorraine Examinateur<\/h4>\n
M. Roland MARMEISSE Directeur de Recherche CNRS Examinateur<\/h4>\n
M. Lionel MOULIN Charg\u00e9 de Recherche IRD Examinateur<\/h4>\n
Mme Pascale FREY-KLETT Directrice de Recherche INRA Invit\u00e9e<\/h4>\n
M. Phil OGER Charg\u00e9 de Recherche CNRS Invit\u00e9<\/h4>\n
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R\u00e9sum\u00e9<\/h1>\n
La disponibilit\u00e9 des nutriments est un param\u00e8tre fondamental des cycles biog\u00e9ochimiques qui r\u00e9git la fertilit\u00e9 d\u2019un sol et le fonctionnement d\u2019un \u00e9cosyst\u00e8me. Parmi les \u00e9cosyst\u00e8mes terrestres, les for\u00eats d\u00e9velopp\u00e9es sur sols acides et pauvres en \u00e9l\u00e9ments nutritifs de nos r\u00e9gions temp\u00e9r\u00e9es sont parmi les \u00e9cosyst\u00e8mes les moins amend\u00e9s par l\u2019Homme, en comparaison des sols agricoles, et qui de plus subissent une exploitation grandissante de la ressource bois. Ces caract\u00e9ristiques n\u2019emp\u00eachent pourtant pas les for\u00eats de croitre. Dans ce contexte, on peut se demander d\u2019ou proviennent les \u00e9l\u00e9ments nutritifs n\u00e9cessaires au maintien de la croissance et de la sant\u00e9 des peuplements forestiers ? En dehors des apports li\u00e9s aux d\u00e9p\u00f4ts atmosph\u00e9riques et au recyclage des \u00e9l\u00e9ments nutritifs contenus dans les racines mortes et les feuilles, les min\u00e9raux du sol sont la source majeure de cations nutritifs disponible pour le fonctionnement \u00e0 long terme de l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me. La lib\u00e9ration des nutriments \u00e0 partir de ces min\u00e9raux devient d\u00e8s lors un processus d\u00e9terminant pour le bon fonctionnement de l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me forestier.<\/h4>\n
Cependant, du fait des conditions r\u00e9gnant dans ces sols (pH acide), les min\u00e9raux les plus alt\u00e9rables ont \u00e9t\u00e9 dissouts, ne laissant que des min\u00e9raux faiblement alt\u00e9rables tels que les silicates par exemple. La lib\u00e9ration des nutriments \u00e0 partir de ces min\u00e9raux devient d\u00e8s lors un facteur d\u00e9terminant pour le bon fonctionnement de l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me. Mais comment cette alt\u00e9ration min\u00e9rale s\u2019op\u00e8re-t-elle ? Quelles sont les contributions relatives des r\u00e9actions abiotiques et biotiques dans ce processus d\u2019alt\u00e9ration ? Si les processus abiotiques sont relativement bien connus, l\u2019action de la composante biotique (arbre, champignon\u2026) et notamment des communaut\u00e9s bact\u00e9riennes des sols reste peu document\u00e9e. L\u2019enjeu actuel est donc de d\u00e9terminer : i) les acteurs et leurs interactions, ii) leur contribution au processus d\u2019alt\u00e9ration min\u00e9rale et \u00e0 la fertilit\u00e9 des sols, iii) d\u2019identifier les m\u00e9canismes mol\u00e9culaires impliqu\u00e9s dans le processus d\u2019alt\u00e9ration des min\u00e9raux et iv) les moteurs de la structuration des ces communaut\u00e9s microbiennes.<\/h4>\n
Depuis mon recrutement en tant que charg\u00e9 de recherche en 2005, j\u2019ai combin\u00e9 une d\u00e9marche d\u2019\u00e9cologie microbienne (pasteurienne et m\u00e9tag\u00e9nomique) afin de d\u00e9crire la structure taxonomique et fonctionnelle des communaut\u00e9s bact\u00e9riennes des sols forestiers, une d\u00e9marche m\u00e9canistique visant \u00e0 identifier et caract\u00e9riser les m\u00e9canismes mol\u00e9culaires et les d\u00e9terminants g\u00e9n\u00e9tiques impliqu\u00e9s dans la capacit\u00e9 \u00e0 alt\u00e9rer les min\u00e9raux, et enfin une approche de biog\u00e9ochimie. Cette interdisciplinarit\u00e9 a pu se faire du fait de mon recrutement \u00e0 l\u2019interface entre deux laboratoires du Centre INRA de Nancy (d\u00e9partement EFPA), l\u2019UMR IAM et l\u2019UR BEF. La combinaison de ces approches a permis de mettre en \u00e9vidence qu\u2019un enrichissement de bact\u00e9ries alt\u00e9rantes s\u2019op\u00e9rait au niveau du syst\u00e8me racinaire des arbres, sugg\u00e9rant que les arbres s\u00e9lectionnent des auxiliaires microbiens pour assurer leur nutrition. Plusieurs \u00e9tudes ont par ailleurs d\u00e9montr\u00e9 que l\u2019enrichissement de bact\u00e9ries \u00e0 fort potentiel d\u2019alt\u00e9ration \u00e9tait li\u00e9 \u00e0 des conditions de faible disponibilit\u00e9 en cations nutritifs et potentiellement aux besoins nutritifs des arbres. Ces liens entre l\u2019arbre, la disponibilit\u00e9 en cations nutritifs et la structuration des communaut\u00e9s bact\u00e9riennes des sols ont \u00e9t\u00e9 confirm\u00e9s par l\u2019utilisation de m\u00e9thodes ind\u00e9pendantes de la mise en culture. En effet, les approches bas\u00e9es sur le s\u00e9quen\u00e7age de g\u00e8nes marqueurs ou de l\u2019ADN environnemental ont mis en \u00e9vidence qu\u2019une s\u00e9lection de communaut\u00e9s bact\u00e9riennes sp\u00e9cifiques s\u2019op\u00e9rait au niveau du syst\u00e8me racinaire des arbres, avec l\u2019enrichissement de taxons pr\u00e9sentant de fortes homologies avec les s\u00e9quences des souches bact\u00e9riennes alt\u00e9rantes isol\u00e9es des m\u00eames sites. De mani\u00e8re int\u00e9ressante, la disponibilit\u00e9 en cations nutritifs est la aussi apparue comme un param\u00e8tre fort de structuration, r\u00e9v\u00e9lant notamment que les min\u00e9raux des sols forestiers sont fortement colonis\u00e9s par des communaut\u00e9s bact\u00e9riennes, capables d\u2019alt\u00e9rer les min\u00e9raux, et que cette s\u00e9lection varie en fonction de la nature chimique et de l\u2019alt\u00e9rabilit\u00e9 des min\u00e9raux.<\/h4>\n
L\u2019ensemble de ces travaux forme un tout coh\u00e9rant qui sugg\u00e8re que les communaut\u00e9s bact\u00e9riennes des sols forestiers jouent un r\u00f4le important dans le cycle des nutriments et la nutrition des arbres, en contribuant \u00e0 lib\u00e9rer des cations nutritifs via l\u2019alt\u00e9ration des min\u00e9raux du sol. Ce processus semble n\u00e9anmoins r\u00e9gul\u00e9 par les conditions de disponibilit\u00e9 en cations nutritifs du milieu.<\/h4>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"