{"id":4129,"date":"2014-09-11T19:09:15","date_gmt":"2014-09-11T19:09:15","guid":{"rendered":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/IAM\/?p=4129"},"modified":"2014-09-11T19:11:34","modified_gmt":"2014-09-11T19:11:34","slug":"phd-defense-j-galet","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/IAM\/?p=4129","title":{"rendered":"PhD Defense: J. Galet"},"content":{"rendered":"

The defense will be held the 16th September 2014<\/strong>\u00a0at 14H00<\/strong>\u00a0in\u00a0Amphitheater 7,<\/strong>\u00a0Facult\u00e9 des Sciences<\/strong>, Boulevard des Aiguillettes, Vandoeuvre<\/p>\n

“Vers la<\/b> compr\u00e9hension des dialogues microbiens dans l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me sol : <\/b>\u00e9tude<\/b> de l’interaction entre Streptomyces<\/i> et Pseudomonas”<\/i><\/b><\/h1>\n

 <\/p>\n

R\u00e9sum\u00e9:\u00a0<\/b><\/p>\n

<\/big>Les Streptomyces<\/i> sont des bact\u00e9ries communes des \u00e9cosyst\u00e8mes forestiers temp\u00e9r\u00e9s. Elles sont pr\u00e9sentes au sein de diff\u00e9rentes niches \u00e9cologiques telles que la rhizosph\u00e8re des plantes, la mycorhizosph\u00e8re ou encore la min\u00e9ralosph\u00e8re. Dans ces niches, elles interagissent avec de nombreux autres genres bact\u00e9riens et diff\u00e9rents champignons symbiotiques, pathog\u00e8nes et saprophytes. Bien que les membres du genre Streptomyces<\/i> soient bien connus pour leur capacit\u00e9 \u00e0 produire une grande vari\u00e9t\u00e9 de m\u00e9tabolites secondaires, le r\u00f4le \u00e9cologique de ces produits naturels reste largement inconnu. Si leur r\u00f4le en tant que mol\u00e9cules antagonistes est probable, ils pourraient \u00e9galement fournir des signaux chimiques dans la communication intercellulaire et jouer un r\u00f4le majeur dans la structuration des communaut\u00e9s microbiennes du sol. La question se pose alors de savoir si en retour, l’environnement biotique de Streptomyces<\/i> module les voies de biosynth\u00e8se de m\u00e9tabolites secondaires chez ces bact\u00e9ries et s\u2019il impacte leur comportement au sein des communaut\u00e9s microbiennes du sol.<\/p>\n

Afin de r\u00e9pondre \u00e0 ces questions, nous avons entrepris une \u00e9tude sur l’interaction entre deux souches bact\u00e9riennes mod\u00e8les du sol Streptomyces ambofaciens<\/i> ATCC23877 et Pseudomonas fluorescens<\/i> BBc6R8. S.\u00a0ambofaciens<\/i> ATCC23877 est connue pour produire au moins cinq mol\u00e9cules antimicrobiennes et deux sid\u00e9rophores et l’analyse de son g\u00e9nome a r\u00e9v\u00e9l\u00e9 la pr\u00e9sence de 16 clusters de g\u00e8nes suppl\u00e9mentaires impliqu\u00e9s dans la synth\u00e8se de m\u00e9tabolites secondaires. P. fluorescens <\/i>BBc6R8 est une bact\u00e9rie auxiliaire de mycorhization isol\u00e9e de fructifications du champignon Laccaria bicolor<\/i>. Des exp\u00e9riences de cocultures sur diff\u00e9rents milieux g\u00e9los\u00e9s ont r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que chaque souche bact\u00e9rienne affecte la production de m\u00e9tabolites secondaires chez l’autre partenaire. Ainsi, P. fluorescens<\/i> inhibe la capacit\u00e9 de S.\u00a0ambofaciens<\/i> \u00e0 produire la kinamycine, un \u00ab\u00a0effet ping-pong\u00a0\u00bb a \u00e9t\u00e9 mis en \u00e9vidence. D’autre part, sur un milieu d\u00e9ficient en fer, P. fluorescens<\/i> est capable d’utiliser les desferrioxamines et la coelicheline produites par S. ambofaciens<\/i> en tant que x\u00e9nosiderophores et ne produit alors plus ses propres sid\u00e9rophores, la pyoverdine et l\u2019\u00e9nantio-pyoch\u00e9line. La prot\u00e9ine FoxA de P. fluorescens<\/i> BBc6R8, un r\u00e9cepteur TonB-d\u00e9pendant, est impliqu\u00e9e dans la d\u00e9tection et l\u2019utilisation de ces deux sid\u00e9rophores de S. ambofaciens <\/i>ATCC 23877. Enfin, au cours des \u00e9tudes d\u2019interactions, P. fluorescens<\/i> BBc6R8 s\u2019est r\u00e9v\u00e9l\u00e9e capable d\u2019inhiber la production du pigment bleu diffusible gamma-actinorhodine chez Streptomyces coelicolor <\/i>A3(2) M145 en acidifiant le milieu par la production d\u2019acide gluconique. D\u2019autres souches de Pseudomonas <\/i>fluorescent et la souche opportuniste Pseudomonas aeruginosa<\/i> PAO1 emp\u00eache, de la m\u00eame mani\u00e8re, la production de gamma-actinorhodine. L\u2019ensemble de ces r\u00e9sultats nous permet de proposer diff\u00e9rentes hypoth\u00e8ses sur l\u2019importance \u00e9cologique de ces trois interactions en les repla\u00e7ant au sein du contexte de l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me sol.<\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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