{"id":8829,"date":"2018-04-04T06:25:01","date_gmt":"2018-04-04T06:25:01","guid":{"rendered":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/IAM\/?p=8829"},"modified":"2018-04-04T06:25:01","modified_gmt":"2018-04-04T06:25:01","slug":"phd-position-4","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/IAM\/?p=8829","title":{"rendered":"PhD Position"},"content":{"rendered":"

English version below<\/em><\/p>\n

Offre de th\u00e8se\u00a0: Identification et caract\u00e9risation d\u2019enzymes microbiennes pour la d\u00e9pollution de bois trait\u00e9s.<\/strong><\/p>\n

Chaque ann\u00e9e en France, 1,4 Mt de d\u00e9chets sont produites sous forme de bois trait\u00e9s. Actuellement, aucune fili\u00e8re de recyclage de ces bois n\u2019est disponible \u00e0 cause de la toxicit\u00e9 des compos\u00e9s utilis\u00e9s en amont pour leur pr\u00e9servation. L\u2019objectif de ce projet est de d\u00e9velopper une nouvelle strat\u00e9gie utilisant des microorganismes et\/ou des enzymes microbiennes comme biocatalyseurs pour l\u2019\u00e9limination des compos\u00e9s toxiques dans les bois trait\u00e9s dans le but de (i) limiter l\u2019impact de ces mol\u00e9cules sur l\u2019environnement et la sant\u00e9 humaine, et (ii) \u00e0 terme pouvoir utiliser cette source importante de d\u00e9chets comme biomasse valorisable au niveau industriel. L\u2019hypoth\u00e8se de travail est bas\u00e9e sur le fait que certains microorganismes isol\u00e9s ou en consortium poss\u00e8dent des capacit\u00e9s accrues de r\u00e9sistance aux fongicides utilis\u00e9s, des syst\u00e8mes enzymatiques performants pour la d\u00e9gradation de mol\u00e9cules complexes, et la capacit\u00e9 de s\u00e9cr\u00e9ter des sid\u00e9rophores pour le pi\u00e9geage des m\u00e9taux. Le travail du candidat recrut\u00e9 consistera \u00e0 tester les capacit\u00e9s de champignons et bact\u00e9ries \u00e0 d\u00e9polluer des bois trait\u00e9s et comprendre les m\u00e9canismes mol\u00e9culaires impliqu\u00e9s gr\u00e2ce \u00e0 des approches de g\u00e9nomique, transcriptomique et prot\u00e9omique. Ces approches \u00e0 grande \u00e9chelle permettront de s\u00e9lectionner des prot\u00e9ines candidates qui seront produites en syst\u00e8me h\u00e9t\u00e9rologue et caract\u00e9ris\u00e9es plus finement au niveau biochimique et fonctionnel.<\/p>\n

L\u2019Unit\u00e9 Mixte de Recherche INRA\/Universit\u00e9 de Lorraine 1136 Interactions Arbres\/Micro-organismes (IAM) \u00e9tudie la biologie et l\u2019\u00e9cologie des interactions entre micro-organismes et arbres forestiers.\u00a0Les recherches de l\u2019Unit\u00e9 visent \u00e0 am\u00e9liorer notre connaissance et notre compr\u00e9hension des interactions qui s\u2019\u00e9tablissent entre les arbres, les champignons et les bact\u00e9ries rhizosph\u00e9riques, et qui contribuent au fonctionnement et \u00e0 la durabilit\u00e9 des \u00e9cosyst\u00e8mes forestiers.<\/p>\n

L\u2019UMR IAM \u00a0est organis\u00e9e en trois \u00e9quipes\u00a0soutenues par des plateaux techniques :<\/p>\n

Equipe R\u00e9ponse aux stress et r\u00e9gulation redox<\/p>\n

Equipe Ecog\u00e9nomique des interactions<\/p>\n

Equipe Ecologie des champignons pathog\u00e8nes forestiers<\/p>\n

L\u2019Unit\u00e9 IAM fait partie du Laboratoire d\u2019Excellence ARBRE\u00a0et est\u00a0reconnue par l\u2019 \u201cAgreenSkills\u00a0mobility programme\u201c.<\/p>\n

Le candidat s’int\u00e9grera dans l’\u00e9quipe R\u00e9ponse aux stress et r\u00e9gulation redox de l’UMR IaM 1136 situ\u00e9e sur le campus de la Facult\u00e9 des Sciences et Technologie de l\u2019Universit\u00e9 de Lorraine \u00e0 Vandoeuvre-l\u00e8s-Nancy. Des comp\u00e9tences en microbiologie et biologie mol\u00e9culaire sont requises. Des comp\u00e9tences en biochimie et bioinformatique seraient un avantage suppl\u00e9mentaire.<\/p>\n

Contact\u00a0: M\u00e9lanie Morel-Rouhier<\/p>\n

Email\u00a0: Melanie.Morel@univ-lorraine.fr<\/a><\/p>\n

Site Web\u00a0: https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/IAM\/<\/p>\n

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English version:<\/em><\/p>\n

\u00a0<\/em>Identification and characterization of microbial enzymes for wood decontamination. <\/strong><\/p>\n

\u00a0<\/em>1.4 Mt of wood wastes are produced each year in France and no recycling is possible because of the toxicity of the products used for wood preservation. The main objective of the proposal is to develop a new strategy using microorganisms and\/or microbial enzymes as biocatalysts for wood decontamination. The aim is to (i) limit the impact of the toxic compounds on the environment and human health and (ii) be able to recycle and valorize wood waste biomass. The working hypothesis is based on the fact that microorganisms either as single species or in consortium exhibit increased ability to resist to the toxic compounds, possess efficient enzymatic systems for complex molecules degradation and are able to secrete siderophores for metal sequestration. The PhD project will be to test the ability of fungi and bacteria to detoxify wood waste and understand the molecular mechanisms involved in the process, thanks to genomic, transcriptomic and proteomic approaches. These global analyses will help identifying molecular actors for further biochemical and functional characterization after production and purification of the recombinant proteins in heterologous systems.<\/p>\n

Research projects performed by the UMR INRA\/Lorraine University 1136 \u00abInteractions Arbres-Microorganismes \u00bb<\/strong> are dedicated to the biology and the ecology of the interactions between microorganisms and forest trees.<\/p>\n

The\u00a0ultimate goals of these projects are\u00a0to improve our knowledge and our understanding of the interactions that take place between trees, fungi and bacteria, and that contribute to the sustainable functioning of forest ecosystems.<\/p>\n

The Department\u00a0is organized into three teams:<\/strong><\/p>\n