dans la salle de conf\u00e9rence du b\u00e2timent des SDAR le vendredi 21 juin \u00e0 9h00.<\/p>\n\n\n\n
R\u00e9sum\u00e9: <\/p>\n\n\n\n
Les m\u00e9canismes expliquant le maintien de la diversit\u00e9 v\u00e9g\u00e9tale dans les for\u00eats tropicales sont mal connus. Une hypoth\u00e8se particuli\u00e8rement \u00e9tudi\u00e9e est l\u2019hypoth\u00e8se Janzen-Connell qui postule que ces m\u00e9canismes sont essentiellement caus\u00e9s par les interactions entre les plantes et leurs ennemis naturels, en particulier les organismes pathog\u00e8nes. Dans cette th\u00e8se, nous nous sommes donc int\u00e9ress\u00e9s aux agents pathog\u00e8nes pr\u00e9sents dans les sols d\u2019une for\u00eat n\u00e9otropicale guyanaise et \u00e0 leur lien de sp\u00e9cificit\u00e9 avec les plantes. Dans le cas o\u00f9 l\u2019hypoth\u00e8se Janzen-Connell serait v\u00e9rifi\u00e9e, on peut s\u2019attendre \u00e0 ce que les plantes structurent les communaut\u00e9s de micro-organismes pathog\u00e8nes. Nos travaux se sont focalis\u00e9s sur les Oomyc\u00e8tes et en particulier les Phytophthora, pathog\u00e8nes des arbres tr\u00e8s importants, mais nous nous sommes aussi int\u00e9ress\u00e9s aux champignons pathog\u00e8nes. Jean Legeay soutiendra sa th\u00e8se intitul\u00e9e: “Ecologie des Oomyc\u00e8tes et champignons phytopathog\u00e8nes dans les sols des for\u00eats de Guyane Fran\u00e7aise\u00a0: \u00e9clairages sur les relations sp\u00e9cifiques entre les communaut\u00e9s de\u00a0Phytophthora et d\u2019arbres” dans la salle de conf\u00e9rence du b\u00e2timent des SDAR … Continue reading
Ainsi, nous avons d\u00e9velopp\u00e9 et compar\u00e9 des jeux d\u2019amorces PCR sp\u00e9cifiques des Phytophthora et des P\u00e9ronosporomyc\u00e8tes afin d\u2019\u00e9tudier ces organismes par metabarcoding. Ces amorces ont ensuite servi \u00e0 \u00e9tudier la diversit\u00e9 des communaut\u00e9s de Phytophthora dans des \u00e9chantillons de sols de deux sites forestiers de Guyane Fran\u00e7aise pr\u00e9lev\u00e9s au pied d\u2019arbres appartenant \u00e0 10 familles v\u00e9g\u00e9tales. Une faible diversit\u00e9 a \u00e9t\u00e9 retrouv\u00e9e, avec seulement 8 esp\u00e8ces ou taxons en tout, et la tr\u00e8s large dominance d\u2019un complexe d\u2019esp\u00e8ces Phytophthora heveae. La structuration par la plante-h\u00f4te de ces communaut\u00e9s est plut\u00f4t faible. Dans une \u00e9tude compl\u00e9mentaire, nous avons analys\u00e9 la diversit\u00e9 des Oomyc\u00e8tes (dont le genre Phytophthora) et des champignons pathog\u00e8nes dans les sols et les liti\u00e8res de six plantations monosp\u00e9cifiques et au sein d\u2019une for\u00eat naturelle de Guyane Fran\u00e7aise. La structuration par l\u2019h\u00f4te s\u2019est av\u00e9r\u00e9e nulle pour les Oomyc\u00e8tes et faible, bien que significative, pour les champignons pathog\u00e8nes. Enfin, nous n\u2019avons pas r\u00e9ussi \u00e0 d\u00e9clencher exp\u00e9rimentalement des mortalit\u00e9s ou d\u00e9p\u00e9rissements par des Oomyc\u00e8tes sur le wacapou, une esp\u00e8ce d\u2019arbre guyanaise, via des inoculations de sols de for\u00eat.
Au final, les r\u00e9sultats de cette th\u00e8se ne supportent pas l\u2019hypoth\u00e8se selon laquelle les Oomyc\u00e8tes seraient d\u2019importants acteurs du maintien de la diversit\u00e9 v\u00e9g\u00e9tale dans les for\u00eats tropicales. Par ailleurs, ils nous interrogent sur la faible diversit\u00e9 de ce groupe de microorganismes dans les sols et liti\u00e8res dans un hotspot de diversit\u00e9 v\u00e9g\u00e9tale.<\/p>\n\n\n\n![\"\"](\"https:\/\/mycor.iam.inrae.fr\/IAM\/wp-content\/uploads\/2019\/06\/these-Jean-Legeay-1-1024x768.jpg\")
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