Mise au point d’une méthode moléculaire permettant d’identifier et de différencier les individus de la Mérule pleureuse, champignon décomposeur du bois

Responsable scientifique : Francis Martin (UMR IAM, INRA Nancy)

Partenaires Labex : Dominique Barry-Etienne (Société ALCINA, Montpellier)

Actions thématiques (WP) d’ARBRE en lien avec ce projet : WP1 et WP3

____________________________

Contexte – La mérule (Serpula lacrymans) est un champignon lignivore qui se développe dans le bois des structures des bâtiments trop humides, mal aérés et/ou mal entretenus. A terme, la colonisation par le champignon conduit à la formation de pourritures brunes qui affectent directement la solidité du bois rendant le bâtiment dangereux. Les dégâts financiers qui en résultent pour les particuliers, pour les assurances et pour les collectivités sont considérables. Mais ce sont surtout les dégâts corporels humains, suite à l’ effondrement d’un bâtiment, qui sont potentiellement catastrophiques. Au regard de la vitesse du front de progression de la mérule sur le territoire français et au regard de l’obligation à terme de délivrer un certificat de non présence de ce champignon dans un bien, il ressort que la mise au point d’outils innovants pour détecter et identifier génétiquement et précocement ce champignon s’avère aujourd’hui opportune.

Objectifs – L’UMR IaM et de la Société Alcina proposent la mise au point d’une méthode moléculaire permettant d’identifier et de différencier les individus de mérule par des outils basés sur le polymorphisme de la séquence du génome nucléaire du champignon.

Démarche – Deux méthodes sont évaluées pour leur aptitude à distinguer des individus génétiquement différents (génotypes) : (1) l’analyse de leur profil en séquences répétées micro-satellitaires et (2) la comparaison de leur séquence génomique par re-séquençage à haut débit et alignement des séquences sur le génome nucléaire de référence de Serpula lacrymans afin d’identifier de nouveaux marqueurs moléculaires polymorphes, dont des variants nucléotidiques (SNPs). Les outils moléculaires mis au point dans ce partenariat, seront valorisés et commercialisés par la société ALCINA. La société  s’engage à faire connaître auprès des professionnels travaillant sur l’expertise des maisons, les instituts FCBA, CTBA la mise au point des nouveaux outils. Elle proposera ses outils auprès des organismes de recherche ou d’expérimentations pour leur travaux de recherche.