Compte-rendu de la conférence International Union of Forest Research Organizations (IUFRO)
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Du 15 au 20 juin 2014 s’est tenue à Fort Collins (Colorado, USA) une conférence internationale de l’IUFRO intitulée “Challenges and Opportunities in Genetics of Five-Needle Pines and Rusts of Forest Trees Research: Conservation, Evolution and Sustainable Management in a Changing Climate“.

Cette conférence, qui a réuni pour la première fois deux groupes de travail de l’IUFRO (WP 2.02.15 Breeding and Genetic Resources of Five-Needle Pines & WP 7.02.05 Rusts of Forest Trees) et le groupe Strobusphere, a rassemblé 105 scientifiques venant du monde entier (Autriche, Canada, Chine, Finlande, France, Allemagne, Inde, Italie, Corée, Mexique, Portugal, Russie, Arabie Saoudite, Suède, USA, Viêt-Nam).

La conférence a porté principalement sur les avancées de la conservation des ressources génétiques, la génomique, la résistance aux rouilles, les impacts du changement climatique, et la dynamique évolutive. En plus des deux jours de conférences plénières et en parallèle, nous avons eu la chance de participer à trois visites de terrain dans les paysages grandioses des montagnes rocheuses : sud du Wyoming (écosystèmes à Pinus flexilis); Parc National des Montagnes Rocheuses (écosystèmes à P. flexilis); Mont Goliath et Mont Evans (écosystèmes à Pinus aristata).

Les principales questions abordées et les dernières découvertes dans le domaine ont concerné :

• Les progrès de la génomique chez les arbres forestiers (génome de Pinus lambertiana) et les rouilles des arbres forestiers (génomes des Cronartium spp. et des Melampsora spp.)
• Les travaux sur la résistance aux rouilles chez les arbres forestiers
• La biologie, l’épidémiologie, et les interactions hôte-pathogène
• La conservation des ressources génétiques des pins à cinq aiguilles
• L’impact du changement climatique sur les pins à cinq aiguilles

La recherche française était bien représentée, avec cinq participants (Inra Nancy & Orléans), dont trois de l’UMR IAM, qui remercient le LabEx ARBRE pour son soutien financier.

Contact P. Frey ; pascal.frey@nancy.inra.fr

Le LabEx ARBRE lance son quatrième appel à projets. Il a pour objectif de soutenir des projets originaux en accord avec les quatre actions thématiques du LABEX ARBRE (biologie intégrative, écologie fonctionnelle, bois-matériau et économie forestière), se situant sur des fronts de science ou présentant un potentiel de valorisation important. La multi-disciplinarité et le caractère intégratif seront privilégiés.

Un objectif prioritaire d’ARBRE est également de promouvoir le couplage entre recherche et formation. Des actions de formation et de médiation scientifique mobilisant les activités des équipes du LabEx sont donc aussi fortement encouragées.

Date limite de dépôt des projets : 1er décembre 2014
par e-mail à klett@nancy.inra

L’unité IAM (Interactions Arbres/Microorganismes) organise le premier workshop d’annotation du génome du Chêne

INRA Nancy-Lorraine Centre
5-7 novembre 2014

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Le génome du Chêne pédonculé Quercus robur a récemment été séquencé par l’UMR BIOGECO à l’INRA de Pierroton en collaboration avec le GENOSCOPE (CEA – Evry) et plusieurs équipes françaises dans le cadre du projet ANR GENOAK. Il s’agit là du premier génome de Chêne séquencé, un évènement important en génomique forestière, visant un arbre majeur pour la recherche forestière française.

Le workshop d’annotation du génome du Chêne organisé sur le Centre INRA de Nancy Lorraine du 5 au 7 novembre 2014 regroupera une trentaine de scientifiques français et étrangers qui étudieront des gènes d’intérêts au sein du génome en lien avec des caractères spécifiques du Chêne pédonculé. Le but de ce workshop est de fournir aux scientifiques concernés les outils et les méthodes pour valider les quelques 50000 gènes identifiés dans ce génome par des méthodes bioinformatiques. L’UMR 1136 Interactions Arbres-Microorganismes qui organise ce workshop avec le soutien du Labex ARBRE, s’appuiera sur son expertise dans l’annotation des génomes eucaryotes pour contribuer à l’analyse de ce génome.

Lien projet GENOAK : https://w3.pierroton.inra.fr/QuercusPortal/index.php?p=OAK_GENOME_SEQUENCING

Contact : Christophe Plomion (plomion@pierroton.inra.fr)
Crédit photo : Antoine Kremer – INRA Pierroton

Invitation à deux ateliers méthodologiques de génomique des populations

le mardi 18 novembre 2014

INRA Centre Nancy-Lorraine, Champenoux

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Les thématiques du réseau « Génétique » du Département EFPA recouvrent l’ensemble des variations possible autour de la génétique envisagée au sein du Département : génétique des populations, génétique quantitative, amélioration et concernent tous les types de modèles (animaux, végétaux et microbiens, mais aussi théoriques).

Dans le cadre de la réunion annuelle du groupe des généticiens du Département EFPA de l’INRA et avec le soutien du Labex ARBRE, nous organisons le 18 novembre 2014 deux ateliers de formations aux méthodes d’analyse de données de génomique des populations.

Les deux ateliers sont :

• Inférence de l’histoire des populations avec la méthode Approximate Bayesian Computation (ABC) – animé par Miguel Navascuès (INRA Montpellier) et

• Détection de loci sélectionnés grâce aux scans génomiques – animé par Simon Boitard (ISYEB – UMR L’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité / CNRS / Muséum national d’Histoire naturelle de Paris).

Pour plus d’informations, voir la page suivante :  EFPA Colloque Réseau Génétique – Ateliers

Dix places ont été réservées aux membres des UMR de Labex qui seraient intéressés. La formation est ouverte aux chercheurs, ingénieurs, doctorants et post-doctorants. Les bases de la génétique des populations seront utiles pour bien comprendre les concepts développés au cours de ces ateliers, mais leur objectif premier consiste à savoir appliquer les méthodes.

Si vous êtes intéressés, merci de vous manifester auprès de Stéphane De Mita (<sdemita@nancy.inra.fr>) avant le 15 octobre. Si vous ne pouvez assister qu’à une demi-journée, merci de préciser à quel atelier vous souhaiteriez participer.

Les Premières Rencontres Alternatives du Champignon

Samedi 4 octobre
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à l’occasion de l’inauguration du Champi’Parc

Les Petits Débrouillards du Grand Est ont l’immense plaisir de vous convier aux Premières Rencontres Alternatives du Champignon. Ils organisent, avec de nombreux partenaires engagés à nos cotés, ce Festival citoyenno-scientifique, à l’occasion de l’inauguration du Champi’Parc (samedi 4 octobre 18h). Le Champi’Parc est une champignonnière collaborative, lieu de culture de champignons, d’expérimentation de cultures, lieu de vie et d’animation scientifiques.

Les Rencontres Alternatives du Champignon ont lieu sur le Site des Brasseries à Maxéville:

• Mercredi – 1er Octobre 13-19h
• Samedi – 4 octobre 13-23h
• Dimanche – 5 octobre 13-19h

Au programme :

• Animations / Ateliers de manipulation et de construction (de capteurs numériques, de bacs à champignon, de lombricomposteurs, d’hôtels à insecte…)
• Recensement participatif de la biodiversité
• Sorties cueillettes et identification de champignons en forêt de Haye
• Projections-débat
• Soirée concert et danse…

Veuillez suivre ce lien pour plus d’informations .. 
Les Petits Débrouillards

Pour lire le programme, cliquez ici : Programme

Et ici pour la  Communiqué de presse

Annonce et appel à contributions
pour un colloque sur le thème :

Penser la multifonctionnalité du secteur forestier
dans un contexte changeant et incertain.

Les 19 et 20 novembre, FCBA – Paris

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Le secteur forestier fait face à de grands défis sociétaux, on l’amène en particulier à :

• répondre à des attentes multiples de professionnels, d’usagers et plus généralement de la société,
• affronter des changements tout aussi variés se présentant en outre avec leur lot de risques et d’incertitudes,
• contribuer de manière visible et franche à la bio-économie dans le cadre des transitions écologique et énergétique.

Les sciences économiques, humaines et sociales ont un rôle majeur à jouer aux côtés des autres sciences pour relever ces défis. Elles apparaissent incontournables pour, notamment, raisonner les arbitrages à faire entre les différentes attentes, intégrer les changements, risques et incertitudes de toutes natures dans les stratégies et politiques relatives à la forêt, promouvoir des activités plus respectueuses de l’environnement.

C’est autour de ces questions que le réseau de sciences économiques, humaines et sociales (SEHS) d’ECOFOR vous convie à débattre les 19 et 20 novembre 2014 à Paris, exactement deux ans après le colloque organisé en 2012.

Public visé
Ce colloque s’adresse à des chercheurs, des gestionnaires et tous acteurs se sentant concernés par les relations entre forêt et société. Il vise en particulier les membres du réseau SEHS d’Ecofor mais aussi plus largement tout ceux qui s’intéressent aux sciences économiques, humaines et sociales, à leurs applications et à l’interdisciplinarité.

Programme général prévisionnel
Mercredi 19 novembre 9h30-18h00
Jeudi 20 novembre 9h30-17h00 (selon les contributions)

Inscriptions
Vous pouvez dès maintenant vous inscrire au colloque sur cette page

Appel à contributions
Ce colloque est organisé sur la base des contributions volontaires qui seront proposées. Vous pouvez soumettre une telle contribution en ligne jusqu’au 17 octobre 2014.

Informations pratiques
Lieu du colloque : Institut technologique FCBA, 10 avenue de Saint-Mandé, 75012 Paris

Nathaniel (Nate) Osborne est doctorant au sein du Département de Foresterie de Oregon State University (OSU) où il développe un projet centré sur la modélisation de la croissance chez le sapin de Douglas.

Nate vient de terminer un stage de 3 semaines dans l’unité LERFoB. Ce séjour financé par le LabEx ARBRE a permis :

• d’initier l’intégration du modèle de croissance-qualité ORGANON sous CAPSIS (du 8 au 12 septembre à AMAP à Montpellier sous la direction de François de Coligny)

• de discuter des algorithmes de détection automatique des noeuds dans les billons de résineux à l’aide de la tomographie rayons X (plateau Xylosciences) sous la direction de Francis Colin, Frédéric Mothe et Fleur Longuetaud.

Veuillez suivre ce lien pour l’interview qu’ils nous a accordée récemment : ARBRE Interview – Nate Osborne

Cette année, le Laboratoire d’Économie Forestière (LEF) organise les Journées Jeunes Chercheurs (JJC) du département SAE2 de l’INRA les 25 et 26 septembre 2014, en salle Jacamon à AgroParisTech.

Ces journées sont l’occasion pour la direction du département d’échanger avec les chercheurs récemment recrutés sur l’avancée de leurs travaux, et constituent une occasion intéressante de discussions avec des chercheurs confirmés du département et des enseignants-chercheurs invités. Les chercheurs récemment recrutés et qui n’auraient pas déjà participé à ces JJC viennent présenter leurs travaux, ainsi que les chercheurs ayant bénéficié d’un financement via l’appel d’offres du Conseil Scientifique du Département SAE2.

Télécharger le programme  : Programme JJC Nancy

Pour plus d’informations sur l’organisation de ces journées, s’adresse à Marielle Brunette: marielle.brunette@nancy.inra.fr

Comment concilier l’intensification attendue de l’exploitation de la forêt avec la préservation de sa biodiversité ? Quels indicateurs pour suivre et évaluer l’état de la biodiversité forestière ? Comment la faune et la flore répondent-elles aux modifications de la trame forestière ?

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Trois synthèses à destination des gestionnaires et décideurs rassemblent les éléments de réponses issus de 16 projets de recherche du programme « Biodiversité, gestion forestière et politiques publiques » (BGF) du ministère de l’Écologie :

• Synthèse n°1 – Lisières, connectivité, colonisation : la biodiversité dans l’espace et le temps forestiers.
• Synthèse n°2 – Évaluation de la gestion durable des forêts : quels indicateurs pour la biodiversité forestière ?
• Synthèse n°3 – Biodiversité, production et autres services forestiers : quels compromis pour la gestion forestière ?

Les trois synthèses sont en téléchargement libre sur le site du programme BGF : http://bgf.gip-ecofor.org

Le programme « Biodiversité, gestion forestière et politiques publiques » :

Animé par le Groupement d’intérêt public ECOFOR et soutenu par le ministère de l’Agriculture, le programme incitatif de recherche « Biodiversité, gestion forestière et politiques publiques » du ministère de l’Écologie a pour objectif de développer les connaissances nécessaires à une prise en compte effective de la biodiversité dans la gestion forestière au sens large, c’est-à-dire de l’exploitation forestière à la gestion d’espaces boisés protégés. Depuis sa création en 1996, le programme a soutenu 39 projets et généré de nombreuses publications, recueils et synthèses qui contribuent à éclairer les politiques publiques. En 2014, cinq nouveaux projets étudiant diverses facettes des interactions entre adaptation des forêts au changement climatique et préservation de la biodiversité ont été lancés.