La gestion de la fertilité des sols forestiers est-elle à un tournant ?

Atelier REGEFOR 2013, les 10, 11 et 12 Juin sur le campus de l’INRA à Champenoux

En forêt, le maintien de la fertilité, qui englobe l’ensemble des paramètres physiques, chimiques et biologiques déterminant l’aptitude d’un sol à soutenir une production, n’est pas une préoccupation récente des chercheurs et des gestionnaires. Les grands principes visant à garantir la « bonne gestion » des sols forestiers sont connus, du moins dans leurs grandes lignes, et largement appliqués dans la pratique.

Cependant, l’intérêt que porte la société à cette question a fortement évolué au fil du temps en fonction du contexte énergétique, économique et environnemental. Des enjeux nouveaux et les tensions qui en résultent caractérisent la période actuelle. Les engagements pris par la France en matière de récolte accrue de biomasse forestière, l’évolution des itinéraires sylvicoles et le recours croissant à la mécanisation sont des évolutions susceptibles d’impacter la fertilité. L’adaptation de la gestion au changement climatique, et l’intérêt croissant de la société pour la conservation de la biodiversité appellent d’autres inflexions de la gestion qui ne sont pas sans effet sur la fertilité des sols.

L’Atelier Regefor 2013 propose un point sur les connaissances sur la fertilité des sols forestiers et les cycles biogéochimiques des principaux nutriments dans les écosystèmes forestiers. Il s’appuie sur des approches d’écologie et de biologie des sols et examine les interactions entre sylviculture, gestion des peuplements et fertilité. Il s’intéresse à la gestion à court terme de la fertilité, à des procédures de remédiation, mais également à des perspectives à long terme de son évolution dans le cadre des changements globaux. L’Atelier est essentiellement consacré aux forêts tempérées, mais s’intéresse aussi à des études de cas en forêt tropicale et dans les systèmes agroforestiers. C’est l’occasion de présenter des moyens d’investigation nouveaux (isotopes stables, métagénomique des micro-organismes du sol…), des outils d’aide à la décision et de débattre des pratiques et limites de la remédiation.

L’atelier comporte des sessions de présentations synthétiques, des sessions de présentations volontaires ainsi que des tables rondes et discussions. Il est organisé par l’Inra, AgroParisTechl’Université de Lorraine, le Labex ARBRE et le GIP Ecofor.

Visite du Professeur Phila RAHARIVELOMANANA de l’Université de Polynésie Française

Le lundi 27 mai à 14h dans la bibliothèque du LERMaB à la Faculté des Sciences et Techniques (entrée 4A, 3ème niveau, campus de Vandoeuvre), le Pr Phila RAHARIVELOMANANA présentera ses travaux de recherche dans un séminaire intitulé “Etude des plantes polynésiennes par une approche pluridisciplinaire

Résumé

La situation géographique (118 îles réparties sur environ 5 million de km2 d’océan), climatique et environnementale de la Polynésie française ont procuré des conditions spécifiques lui donnant une biodiversité végétale relativement riche (endémicité 60%). Ce milieu insulaire dispose de produits uniques issus de la biodiversité insulaire, dont certains, font l’objet de consommation ayant une renommée dépassant les frontières de la Polynésie à l’export en tant que produits naturels bruts ou ingrédients pour les produits élaborés dans le domaine de la santé et nutrition ou de la parfumerie et la cosmétique. A côté de ces produits reconnus et exploités commercialement, le capital biodiversité de la Polynésie n’a pas encore révélé toutes ses potentialités en termes de ressources végétales à valoriser de manière durable que ce soit au niveau local ou à l’export. Par ailleurs, les usages des plantes et leurs caractéristiques sont source d’inspiration pour des valorisations innovantes à développer mais avant tout à mieux connaître. Les plantes font partie intégrante des ressources génétiques constituant la biodiversité et méritent à ce titre d’être mieux connues tant pour leur préservation que leur valorisation. L’optimisation de la valorisation de ces ressources génétiques nécessite leur caractérisation par une approche intégrée de manière pluridisciplinaire incluant les aspects botaniques, ethnobotaniques, génétiques, chimiques, biochimiques et l’évaluation des activités biologiques. L’équipe de recherche EIMS (Étude Intégrée des Métabolites Secondaires) de l’UMR 241 EIO s’intéresse à développer de telles études visant une meilleure connaissance de la biodiversité polynésienne en vue de sa valorisation durable. Les arbres font partie des ressources végétales très intéressantes par leurs usages et les constituants qu’ils contiennent fournissant des produits d’intérêt biologique notable. L’exemple d’études menées sur des arbres polynésiens contenant de métabolites bioactifs sera présenté, notamment celles portant sur Santalum insulare, Calophyllum inophyllumet quelques espèces de Wikstroemia endémiques de la Polynésie.

Doc & Postdoc Day

Salle de conférence (INRA-Champenoux)

27 MAI 2013

9h00 – 9h30: Introduction

9h30 – 11h15 : BIODIVERSITÉ ET DISTRIBUTION DES ESPÈCES

09h30 – 09h 45 : Caroline Rolland (EEF) « Effets des pratiques agricoles et des infrastructures agro-écologiques sur la diversité des Chiroptères »

09h45 – 10h00 : Lucy Mayer (EEF) « Importance de la variabilité des traits fonctionnels dans la compréhension de la structuration des communautés végétales de bandes enherbées»

10h00 – 10h30 : Pause café

10h30- 11h00 : Charlotte Grossiord (EEF) « Influence des conditions environnementales sur la relation Biodiversité – Fonctionnement des écosystèmes en forêt boréale»

11h00- 11h15 : Lucie Arnaudet (EEF) « Cœur et périphérie des massifs forestiers : une question d’écologie du paysage ou d’écologie historique ? »

 11h15 – 11h45 : PHYSIQUE DES SOLS

11h15 – 11h45 : Martin Maier (EEF) «Diffusion as exclusive gas transport process in the soil? »

11h45 – 13h30: pause repas

13h30 – 14h30: réponses aux contraintes

13h30-13h45 : Rosmery Robles Leon (EEF) « Effet de la fertilisation du sol sur la résilience des arbres à la sécheresse »

13h45-14h15 : François Bizet (EEF)

14h15-14h30 : Daphné Asse (EEF) « Etude dendroclimatique du hêtre (Fagus sylvatica L.) sur les plateaux calcaires de Bourgogne : analyse des incertitudes générées par les modèles climatiques à maille fine. »

 14h30 – 16h00: dynamiques des réserves

14h30 – 15h00 : Morgane Pluchon (EEF) « Nitrogen dynamics in Eucalyptus, grown in monoculture and in association with Acacia as nitrogen fixing species (NFS) »

15h00 – 15h15 : Mahsa Farjad (EEF) « Impact du mélange robinier/peuplier sur l’assimilation et l’allocation d’azote de peupliers cultivés en plantation à courte rotation »

15h15-15h30 : Mohamed Hamdani (EEF) « Effet de l’introduction d’une espèce fixatrice d’azote (robinier) dans une plantation expérimentale de peupliers (taillis à courte rotation) sur les capacités de mise en réserve du carbone et de l’azote dans les organes pérennes de peupliers. »

15h30-16h00: Cécilia Gana (EEF) « Impact d’un mélange d’espèces fixatrice/non fixatrice d’azote (Robinia pseudoacacia/Populus x euramericana) sur l’allocation et la dynamique du carbone d’une plantation à courte rotation»

16h00 – 16h15: Conclusion et discussions

28 MAI 2013

9h00 – 9h15: Introduction

9h30 – 10H30 : INTERACTIONS PLANTES MICRO-ORGANISMES ET ECOLOGIE MICROBIENNE

9h00 – 9h20 : Clément Pellegrin (IAM) « Functional analysis of putative symbiosis effectors of the ectomycorrhizal symbiont Laccaria bicolor »

9h20 – 9h45 : Stéphane Hacquard (IAM) “The hunt for effectors in the secretome of Melampsora larici-populina

9h45 – 10h10 : Laura Kelly (IAM)  « Bacterial contributions to soil mineral weathering processes in a forest ecosystem »

10h10 – 10h30 : Justine Mauer-Halet (IAM)  « Interactions entre deux bactéries du sol, Streptomyces ambofaciens – Pseudomonas fluorescens »

10h30 – 11h00     Pause

11h00 – 12h05: SESSION CHAMPIGNONS

11h00 – 11h20 : Aurélie Deroy (IAM)  « Evolution et adaptation du système de détoxication chez Trametes versicolor, un champignon dégrandant le bois.»

11h20 – 11h40 : Thibaut Payen (IAM) « Large scale identification and mapping of single nucleotide polymorphisms in black truffle (Tuber melanosporum) by genome resequencing»

11h40 – 12h05 : Sebastian Wittulsky (IAM)   « Manipulation of trehalose biosynthesis in Laccaria bicolor

12h05 – 13h35: PAUSE REPAS

13h35 – 14h25: SESSION CHAMPIGNONS (SUITE)

13h35 – 14h00 : Balázs Vajna (Eötvös Loránd University, Budapest, Hongrie)« Lignocellulose degrading activity of oyster mushroom during substrate colonization and the potential role of bacteria during this process »

14h00 – 14h20 : Alice Vayssières  (IAM) « Reprogramming of root development by the ectomycorrhizal fungus Laccaria bicolor: Involvement of auxin pathways »

 14h20 – 15h00: SESSION BOIS

14h20 – 14h40 : Kevin Candelier (LERMAB) : « Influence of inert atmosphere used (nitrogen and vacuum) during heat treatment of wood on its final physical and chemical properties »

14h40 – 15h00 : Jean Bosco Saha Tchinda (LERMAB) : « Activités antioxidantes, phénols totaux et composition chimique des extraits de quatre essences camerounaises: Moabi, Movingui, Padouk et Tali »

15h00 – 15h05   Zineb Kebbi-Benkeder (Poster) (LERMAB) : « Secondary metabolites in the knots of different tree species »

 

15h05 – 15h35    Pause

15h35 – 16h35: SESSION RÉPONSE AUX STRESS

15h35 – 16h00 : Rita Teixeira :  « Analysis of key transcription factors responsible for root meristem maintenance under biotic and abiotic stress »

16h00 – 16h20 : Henri Pégeot : « Etude structure-fonction des glutathion transférases de la classe Phi chez l’arbre modèle Populus trichocarpa »

16h20 – 16h40 : Anne Thuillier : « Caractérisation fonctionnelle d’une famille de glutathion transférases, enzymes de détoxication d’un champignon ligninolytique »

16h40 – 17H00 : Conclusions et discussions

 

 

 

 

First meeting of the QLSPIMS project

April the 15th
9h30 – General presentation of the project

10h00 – Presentation and discussion on task 1: Deepen the knowledge about the impact of soil nutritional status and soil water availability on tree functioning – carbon assimilation and allocation

11h00 – Presentation and discussion on task 2: Openning a modeling garage, for the set-up of the new generation of phenomenological model suites , and formalizing the response of forest trees and forest ecosystems to environment

12h00 – Lunch

13h00 – 16h00 : Task 2 Modelling Garage – Identification of the main missing processes in forest models for an efficient simulation of C, Water and nutrient cycles (for different species and forest managements – Joana Amaral Paulo will present the modelling work done at ISA – Portugal); Priorities among these processes; Time table and Road map definition

April the 16th
9h30 – 12h00 : Task1 Experimental designs  – Time table for the different operations – Expected growth modifiers and links with Task2 time table and road map.

 

 

 

 

La recherche forestière sous les projecteurs

L’unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers (BEF), partenaire du Labex ARBRE, souhaitait présenter ses missions grâce un produit audiovisuel diffusable au grand public. Dans le cadre de leur projet de fin d’étude, quatre étudiants du BTS Métiers de l’Audiovisuel à Metz, ont réalisé un film encadrés par leur professeur Madame Cécile JEANNOT et avec l’aide du service communication du centre INRA de Nancy-Lorraine. Ce film contient un documentaire présentant l’activité de l’unité autour du suivi d’un échantillon, depuis sa collecte en forêt jusqu’à l’analyse au laboratoire, et un plateau dont la thématique porte sur les rencontres REGEFOR qui auront lieu du 10 au 12 juin 2013 sur le thème “La gestion de la fertilité es sols forestiers est-elle à un tournant?” Ce film réalisé en quatre jours de tournage sur le terrain et au laboratoire sera projeté lors des rencontres REGESOL et participera au Festival du film de chercheur 2013.

 

 

 

AgreenSkills

Courrier des coordinateurs d’AgreenSkills : Gilles Aumont & Odile Vilotte :

Cher collègue,

Nous avons le plaisir de vous rappeler que la prochaine date de clôture de la soumission de dossiers pour des post-doc AgreenSkills est le 15 Mai 2013. La suivante sera le 15 Novembre 2013. AgreenSkills apporte des primes de mobilités sous forme de complément de salaire très consistantes (ce qui permet des salaires bruts mensuels au minimum de 3500 €) qui permettent d’attirer les meilleurs candidats. Les ressources des PIA pour les salaires de base sont éligibles au programme.

Après 2 sessions de sélection le programme AgreenSkills a montré sa capacité à reconnaître et soutenir une grande diversité de projets de qualité, tant en mobilité entrante que sortante, pour différentes sources de financement du salaire de base (crédit d’accueil institutionnels, Métaprogrammes, CJS, crédits régionaux, crédits ANR, …) et pour une large gamme de thématiques scientifiques et approches (fondamentale appliquée, technologique, …).

En 2013, les nombre de recrutements possibles sera significativement supérieur à 2012, environ 35 projets.  Le taux de sélection reste raisonnable , c.a.d. entre 1/4  et1/3 par dossiers soumis

Dans ce contexte,  et compte tenu  de la date prochaine de clôture de la soumission de dossiers,  le 15 Mai 2013,  du délai nécessaire à la publicité de l’offre, à l’identification d’un(de)  bon(s) candidat(s) puis à la constitution des dossiers, nous vous invitons vivement à proposer dès maintenant des positions d’accueil dans vos laboratoires et à engager des recherches actives d’éventuels candidats.

Nous sommes à votre disposition pour vous aider à réussir dans la soumission de projets de qualité (coordinators@agreenskills.eu) .
Dès maintenant, nous vous encourageons à soumettre vos propositions d’accueil en complétant et nous retournant le template (http://www.agreenskills.eu/agreenskills-cms/Applications/Documentation). Nous mettrons votre proposition en ligne sur le site d’AgreenSkills.eu. Par ailleurs, vous pouvez consulter des CV de candidats éligibles en ligne. Pour cela il convient de demander les login/mot de passe auprès de votre DU. Si vous le souhiatez nous pouvons également générer des clefs d’accès afin que vous puissiez vous connecter sur plusieurs sessions d’affilée.

Vous trouverez sur le site www.agreenskills.eu  des réponses à la plupart des questions que vous vous posez. Pour autant nous restons à votre disposition pour tous types de questions et pour vous aider à construire des projets les plus compétitifs. La procédure de sélection est totalement internationale, la constitution des dossiers est simple et les options de recrutement sont très souples.

 

 

 

Les enseignants en forêt

Dans le cadre de l’offre de formations proposée par la Maison pour la Science et la Technologie Lorraine, ARBRE accueille les 2 et 4 avril 2013 sur le campus INRA de Champenoux 15 enseignants de primaire, pour une initiation à la démarche scientifique autour de l’écosystème forestier. La formation proposée a été construite en partenariat avec le Centre Permanent d’Initiatives pour l’Environnement Nancy Champenoux et la Maison Départemental de l’Environnement.

Les enseignants sont mis en situation d’observation de deux parcelles forestières (1ère demi-journée). En quoi sont-elles différentes ? Cette première étape les conduit à poser toutes les questions/hypothèses qui leur viennent à l’esprit. S’en suit alors un temps d’échange avec les formateurs pour discuter de ces différentes hypothèses et imaginer des pistes/approches pour tester ces hypothèses (2ème demi-journée). Cette demi-journée est aussi consacrée à une présentation par un chercheur INRA d’un projet de recherche en lien avec la problématique générale, et à la formalisation d’un nombre plus restreint de questions de recherche, pouvant donner lieu à un travail ultérieur en ateliers. Le 2ème jour est consacré à la découverte d’un autre type d’écosystème – un espace naturel sensible –, et des approches permettant de décrire la biodiversité d’un milieu. Au cours du troisième jour, le travail en ateliers alterne avec des apports de connaissances dispensés par des scientifiques du domaine. A partir des connaissances acquises et des ressources mises à disposition, il s’agit pour les enseignants de proposer des hypothèses en réponse aux questions posées le 1er jour. A la fin du 3ème jour, chaque groupe présente aux autres le fruit de sa réflexion sous forme d’un poster. Le 4ème jour est consacré à la construction de séquences pédagogiques permettant de répondre à chacune des questions dans l’objectif de tester chacune des hypothèses avec une classe. Ce travail est encadré par un maître formateur de l’IUFM.

Tous nos remerciements à Jean Garbaye, Yves Lefèvre et Laurent Saint-André

Avec le soutien de : 

   

LabeX Seminar Series

UFR Conference Room, University of Lorraine, Vandoeuvre Campus

Tuesday 12 March – 8:00-10:00 am

Communication during plant-microbe interactions

Danny Vereecke

Hogeschool Gent, Belgique

 Plants emit a wide variety of compounds that have a significant effect on the behavior of microbes that live in their proximity. Many microbes are attracted by the plant emissions and in response will engage in beneficial but also in pathogenic interactions. To guarantee the success of these interactions, microbes will often first communicate amongst each other, to ensure that the conditions for the onset of the contact are optimal. Finally, in beneficial but also in certain pathogenic interactions, plant and microbe establish an equilibrium permitting a long lasting life together. In this lecture I will try to give an overview of the diversity of molecular communication mechanisms that can occur during plant-microbe interactions using different examples of well-studied symbioses and pathologies.

Bourses CONACYT-Labex pour étudiants mexicains

Comme chaque année, le CONACYT (Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología = équivalent ministère de la recherche) mexicain, offre (sur appel à candidatures conjoint avec l’Ambassade de France au Mexique qui sera clôt le 9 mai 2013 ) des bourses destinées à des étudiants mexicains qui souhaitent faire un doctorat en France.
Chaque bourse est octroyée pour une durée de trois ans. Le doctorant mexicain sélectionné perçoit de son gouvernement une allocation mensuelle de 990 € (1238 pour un étudiant marié) à laquelle se rajoute une bourse de couverture sociale.
Cette année, le CONACYT a souhaité donner une priorité aux étudiants qui déposeront un projet en lien avec un LABEX ou un Institut Carnot.
Le présent message a donc pour but :
– de vous alerter sur ce dispositif et de réserver le meilleur accueil aux étudiants mexicains qui entreraient en contact avec vous pour définir un projet ;
– de vous sensibiliser sur l’opportunité (éventuelle) pour vous d’accueillir un étudiant doctorant bénéficiant d’une bourse de son gouvernement ;
– mais également de vous demander de nous communiquer tout sujet de thèse pour lequel vous seriez en recherche de candidats, afin que nous puissions orienter de manière plus efficace les étudiants mexicains qui se rapprocheront de nous.
Dans le système mis en place par le CONACYT et l’Ambassade, il appartient bien sûr à l’étudiant de monter lui-même son projet de recherche en lien avec le laboratoire et/ou l’école doctorale qu’il aura ciblé(e) en France en concertation avec ce dernier ou cette dernière. La décision d’octroi ou non de la bourse sera prise  conjointement par le CONACYT et l’Ambassade de France au Mexique.
Tout appui complémentaire (à la bourse octroyée à l’étudiant par le CONACYT) que votre Labex pourrait fournir, comme la prise en charge des frais d’inscription universitaire, un complément d’allocation… constituera bien sûr un atout supplémentaire pour que le candidat fasse partie des lauréats.
En vous remerciant par avance pour votre attention et en restant à votre disposition pour toute information complémentaire.
Bien à vous,
Thierry Boisseaux
Agregado para la Ciencia y la Tecnología
Embajada de Francia en México – CCC IFAL
Tel: +52 (55) 91 71 97 82

LabEx Seminar Series

Conference Room (INRA-Nancy, Champenoux), Tuesday 5 February 2013, 2.00 pm

Biogeochemical Cycling in Forests of the Sierra Nevada Mountains: The Classical Conceptual Model Does Not Fit

Dale W. Johnson

Natural Resources and Environmental Science, University of Nevada, Reno, Nevada USA

The classical conceptual models of biogeochemical cycling include inputs by precipitation, Nfixation, and (later) dry deposition. Outputs include leaching or streamflow and sometimes erosion. The classical soil nutrient cycling sub-models portray intense competition between roots and microbes for limiting nutrients, usually nitrogen. Forests of the Sierra Nevada Mountains of Nevada and California do not fit this model. Because of extremely dry summers, roots – and therefore root-microbe competition – are absent in the forest floor (O horizons). Nutrient mineralization in O horizons is carried by water flowing over the mineral soil, which becomes hydrophobic every summer when it dries out.  We find evidence that entry of these nutrient-rich waters into preferential flow paths in soils creates nutrient hotspots, which are nearly always abundant in these soils.

The most significant reason that the classical biogeochemical models are not applicable to Sierran forests is the omission of fire. These forests are naturally prone to fire, and wildfire in recent times has become more frequent and severe because of unnatural fuel buildups and climate warming. On an annualized basis, the losses of nitrogen by volatilization during fires is many orders of magnitude greater than losses by leaching. Fire can indirectly cause net increases in the nitrogen capital of these ecosystems, however, by fostering  post-fire N2 fixing vegetation which inputs N to the system at a rate that is at least an order of magnitude greater than inputs by precipitation. Fire is far more important than water in controlling the fluxes nitrogen in these systems over the long term.