Doc/PostDoc days

Salle de conférence (INRA-Champenoux)

27 MAI 2013

9h00 – 9h30: Introduction

9h30 – 11h15 : BIODIVERSITÉ ET DISTRIBUTION DES ESPÈCES

09h30 – 09h 45 : Caroline Rolland (EEF) « Effets des pratiques agricoles et des infrastructures agro-écologiques sur la diversité des Chiroptères »

09h45 – 10h00 : Lucy Mayer (EEF) « Importance de la variabilité des traits fonctionnels dans la compréhension de la structuration des communautés végétales de bandes enherbées»

10h00 – 10h30 : Pause café

10h30- 11h00 : Charlotte Grossiord (EEF) « Influence des conditions environnementales sur la relation Biodiversité – Fonctionnement des écosystèmes en forêt boréale»

11h00- 11h15 : Lucie Arnaudet (EEF) « Cœur et périphérie des massifs forestiers : une question d’écologie du paysage ou d’écologie historique ? »

 11h15 – 11h45 : PHYSIQUE DES SOLS

11h15 – 11h45 : Martin Maier (EEF) «Diffusion as exclusive gas transport process in the soil? »

11h45 – 13h30: pause repas

13h30 – 14h30: réponses aux contraintes

13h30-13h45 : Rosmery Robles Leon (EEF) « Effet de la fertilisation du sol sur la résilience des arbres à la sécheresse »

13h45-14h15 : François Bizet (EEF)

14h15-14h30 : Daphné Asse (EEF) « Etude dendroclimatique du hêtre (Fagus sylvatica L.) sur les plateaux calcaires de Bourgogne : analyse des incertitudes générées par les modèles climatiques à maille fine. »

 14h30 – 16h00: dynamiques des réserves

14h30 – 15h00 : Morgane Pluchon (EEF) « Nitrogen dynamics in Eucalyptus, grown in monoculture and in association with Acacia as nitrogen fixing species (NFS) »

15h00 – 15h15 : Mahsa Farjad (EEF) « Impact du mélange robinier/peuplier sur l’assimilation et l’allocation d’azote de peupliers cultivés en plantation à courte rotation »

15h15-15h30 : Mohamed Hamdani (EEF) « Effet de l’introduction d’une espèce fixatrice d’azote (robinier) dans une plantation expérimentale de peupliers (taillis à courte rotation) sur les capacités de mise en réserve du carbone et de l’azote dans les organes pérennes de peupliers. »

15h30-16h00: Cécilia Gana (EEF) « Impact d’un mélange d’espèces fixatrice/non fixatrice d’azote (Robinia pseudoacacia/Populus x euramericana) sur l’allocation et la dynamique du carbone d’une plantation à courte rotation»

16h00 – 16h15: Conclusion et discussions

28 MAI 2013

9h00 – 9h15: Introduction

9h30 – 10H30 : INTERACTIONS PLANTES MICRO-ORGANISMES ET ECOLOGIE MICROBIENNE

9h00 – 9h20 : Clément Pellegrin (IAM) « Functional analysis of putative symbiosis effectors of the ectomycorrhizal symbiont Laccaria bicolor »

9h20 – 9h45 : Stéphane Hacquard (IAM) “The hunt for effectors in the secretome of Melampsora larici-populina

9h45 – 10h10 : Laura Kelly (IAM)  « Bacterial contributions to soil mineral weathering processes in a forest ecosystem »

10h10 – 10h30 : Justine Mauer-Halet (IAM)  « Interactions entre deux bactéries du sol, Streptomyces ambofaciens – Pseudomonas fluorescens »

10h30 – 11h00     Pause

11h00 – 12h05: SESSION CHAMPIGNONS

11h00 – 11h20 : Aurélie Deroy (IAM)  « Evolution et adaptation du système de détoxication chez Trametes versicolor, un champignon dégradant le bois.»

11h20 – 11h40 : Thibaut Payen (IAM) « Large scale identification and mapping of single nucleotide polymorphisms in black truffle (Tuber melanosporum) by genome resequencing»

11h40 – 12h05 : Sebastian Wittulsky (IAM)   « Manipulation of trehalose biosynthesis in Laccaria bicolor

12h05 – 13h35: PAUSE REPAS

13h35 – 14h25: SESSION CHAMPIGNONS (SUITE)

13h35 – 14h00 : Balázs Vajna (Eötvös Loránd University, Budapest, Hongrie)« Lignocellulose degrading activity of oyster mushroom during substrate colonization and the potential role of bacteria during this process »

14h00 – 14h20 : Alice Vayssières  (IAM) « Reprogramming of root development by the ectomycorrhizal fungus Laccaria bicolor: Involvement of auxin pathways »

 14h20 – 15h00: SESSION BOIS

14h20 – 14h40 : Kevin Candelier (LERMAB) : « Influence of inert atmosphere used (nitrogen and vacuum) during heat treatment of wood on its final physical and chemical properties »

14h40 – 15h00 : Jean Bosco Saha Tchinda (LERMAB) : « Activités antioxidantes, phénols totaux et composition chimique des extraits de quatre essences camerounaises: Moabi, Movingui, Padouk et Tali »

15h00 – 15h05   Zineb Kebbi-Benkeder (Poster) (LERMAB) : « Secondary metabolites in the knots of different tree species »

15h05 – 15h35    Pause

15h35 – 16h35: SESSION RÉPONSE AUX STRESS

15h35 – 16h00 : Rita Teixeira :  « Analysis of key transcription factors responsible for root meristem maintenance under biotic and abiotic stress »

16h00 – 16h20 : Henri Pégeot : « Etude structure-fonction des glutathion transférases de la classe Phi chez l’arbre modèle Populus trichocarpa »

16h20 – 16h40 : Anne Thuillier : « Caractérisation fonctionnelle d’une famille de glutathion transférases, enzymes de détoxication d’un champignon ligninolytique »

16h40 – 17H00 : Conclusions et discussions

Séminaire Equipe Ronald de Vries

Nous recevrons la visite lundi prochain (13 mai) de Ronald de Vries (Fungal Physiology Lab, CBS-KNAW, Pays-Bas) et de plusieurs membres de son groupe qui donneront deux petits séminaires:
– Alexa Patyshakuliyeva: Extracellular polysaccharide degrading capabilities of various Agaricus bisporus strains during compost cultivation
– Isabelle Benoit: How Aspergillus niger and Bacillus subtilis influence each other’s life
Les présentations débuteront à 14h en salle de réunion du LGEF.

Article: Environ. Microbiol

Two Sinorhizobium meliloti glutaredoxins regulate iron metabolism and symbiotic bacteroid differentiation
Sofiane M BENYAMINA, Fabien BALDACCI-CRESP, Jeremy COUTURIER, Kamel CHIBANI, Julie HOPKINS, Abdelkader BEKKI, Philippe DE LAJUDIE, Nicolas ROUHIER, Jean-Pierre JACQUOT, Genevieve ALLOING, Alain PUPPO, Pierre FRENDO
Environmental microbiology 15 (3), 795-810

Abstract

Legumes interact symbiotically with bacteria of the Rhizobiaceae to form nitrogen-fixing root nodules. We investigated the contribution of the three glutaredoxin (Grx)-encoding genes present in the Sinorhizobium meliloti genome to this symbiosis. SmGRX1 (CGYC active site) and SmGRX3 (CPYG) recombinant proteins displayed deglutathionylation activity in the 2-hydroethyldisulfide assay, whereas SmGRX2 (CGFS) did not. Mutation of SmGRX3 did not affect S. meliloti growth or symbiotic capacities. In contrast, SmGRX1 and SmGRX2 mutations decreased the growth of free-living bacteria and the nitrogen fixation capacity of bacteroids. Mutation of SmGRX1 led to nodule abortion and an absence of bacteroid differentiation, whereas SmGRX2 mutation decreased nodule development without modifying bacteroid development. The higher sensitivity of the Smgrx1 mutant strain as compared with wild-type strain to oxidative stress was associated with larger amounts of glutathionylated proteins. The Smgrx2 mutant strain displayed significantly lower levels of activity than the wild type for two iron-sulfur-containing enzymes, aconitase and succinate dehydrogenase. This lower level of activity could be associated with deregulation of the transcriptional activity of the RirA iron regulator and higher intracellular iron content. Thus, two S. meliloti Grx proteins are essential for symbiotic nitrogen fixation, playing independent roles in bacterial differentiation and the regulation of iron metabolism.